目錄2.資料分析挖掘
（1）專案流程
代謝組學分析的特點：
專案流程
樣本製備——質譜儀分析——資料預處理——定量及統計分析——定性分析——生信及後續分析
（2）非靶代謝質控
質譜儀訊號波動使非靶代謝訊號隨時間漂移。
原因：訊號隨時間漂移或中途裝置維護會嚴重影響多元統計分析效果，如pca中樣品分布不均勻，存在異常值。從而引起後續分析，如篩選生物標誌物失敗。
對非靶代謝訊號時間漂移的重新校準，改善資料分析效果：
（3）靶向代謝質控
不同出峰時間，對應不同的基質效應。
基質效應可能使絕對定量不準確。
無同位素內標：分析物與內標物基質效應不同；
有同位素內標：保留時間及表面活性的微小差別，仍會使分析物與內標物響應不同。
定量準確性質控：
加標**實驗：理論新增值約等於實測增加值（80-120%）。
裝置靈敏度質控：（4）代謝組全流程質控
樣本製備：
質譜儀分析：
資料預處理：
定量及統計分析：
（1）代謝組分類回顧
非靶：進行大規模、系統性研究，用於前期資料探勘與篩選。
靶向：驗證非靶向分析的結果，對目標代謝物進行選擇性、特異性定量與絕對定量。
非靶和靶向的樣本製備、色譜體系、代謝物鑑定模式均不同。
（2）資料預處理
①資料完整性檢查
②資料標準化
（3）定量層面挖掘
①統計分析
②聚類分析
③共表達網路
（4）功能層面挖掘
通路分析
蛋白質組學實驗設計 質控與分析
1 常用流程 流程說明 1.材料收集 細胞 細胞上清 組織 血漿 血清 腦脊液 外泌體 尿液.2.定量技術 蛋白組 itraq tmt labelfree silac 修飾 代謝組 靶向 非靶 3.資料驗證 蛋白組 prm wb elisa 代謝組 mrm 4.深入研究 臨床標誌物 生理病理機制 藥...
代謝組學 1 代謝組學簡介
目錄代謝物 所有分子量小於1500da的小分子物質，包括醣類 核苷 有機酸 酮類化合物 多肽 氨基酸 有機胺類 醛類化合物 脂質 萜類 類固醇 生物鹼 小分子藥物等等。代謝組 乙個細胞 組織 器官中所有代謝物的集合。代謝組學 利用高通量的技術來鑑定和定量乙個細胞 組織或器官中所有小分子或代謝物的生命...
代謝組學 3 資料分析
1.代謝物提取，一般要求每組至少10個樣 2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為qc 3.qc樣本與實驗樣本穿插上機，開始十個qc，結尾三個qc，中間每十個樣本穿插乙個qc樣本 得到質譜譜圖資料經軟體處理後得到峰表。峰 式一般為 每行為乙個m z，每列為乙個樣本 數值表示該樣本中某個m z的訊號響應...