目錄代謝物：所有分子量小於1500da的小分子物質，包括醣類、核苷、有機酸、酮類化合物、多肽、氨基酸、有機胺類、醛類化合物、脂質、萜類、類固醇、生物鹼、小分子藥物等等。
代謝組：乙個細胞、組織、器官中所有代謝物的集合。
代謝組學：利用高通量的技術來鑑定和定量乙個細胞、組織或器官中所有小分子或代謝物的生命科學研究。
非靶向代謝組學
靶向代謝組學
研究目的
無偏向性的對所有小分子代謝物同時進行檢測分析
對指定列表的代謝產物的分子，特別針對一種或幾種途徑的代謝產物
優點無偏向性，高通量，樣本無序特出處理且一次進樣分析
靈敏度高，完全定量，可得到樣本中代謝物的濃度
缺點需要進行複雜的生物資訊學分析；只能獲得半定量的結果
需要購買標準品，進行分析方法的開發、驗證，研究成本高
分析平台
nmr、lc-ms、gc-ms等
hplc、gc、lc-ms、gc-ms等
分析技術
靈敏度mol
優勢缺點
核磁共振nmr
10-6
無創檢測，樣品需求量大；特異性高、解析度高，能夠對代謝物同時完成定性和定量分析
動態範圍有限，靈敏度較低，硬體投資較大
液質聯用lc-ms
10-15
靈敏度、解析度高，可以分析不穩定、不易衍生化、難揮發和分子量較大的代謝物
資料庫不健全，可鑑定的化合物有限
氣質聯用gc-ms
10-12
解析度、選擇性好，資料庫較多
樣品處理過程較為繁瑣，難揮發性物種或半揮發性物種需要衍生化後才能進行分析
代謝組學應用：
ps：tic是在gc-ms或lc-ms等方法中使用的一種色譜圖。質量分析器在可能出現的質荷比範圍內以固定時間間隔重複地掃瞄，檢測系統就可連續不斷的得到變化著的質譜訊號。計算機一邊收集儲存，一邊將每次掃瞄的離子流求和，獲得總離子流。
代謝組學實驗 質控與分析
目錄2.資料分析挖掘 1 專案流程 代謝組學分析的特點 專案流程 樣本製備 質譜儀分析 資料預處理 定量及統計分析 定性分析 生信及後續分析 2 非靶代謝質控 質譜儀訊號波動使非靶代謝訊號隨時間漂移。原因 訊號隨時間漂移或中途裝置維護會嚴重影響多元統計分析效果，如pca中樣品分布不均勻，存在異常值。...
代謝組學 3 資料分析
1.代謝物提取，一般要求每組至少10個樣 2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為qc 3.qc樣本與實驗樣本穿插上機，開始十個qc，結尾三個qc，中間每十個樣本穿插乙個qc樣本 得到質譜譜圖資料經軟體處理後得到峰表。峰 式一般為 每行為乙個m z，每列為乙個樣本 數值表示該樣本中某個m z的訊號響應...
LncRNA與代謝組聯合分析
簡介 長非編碼rna long non coding rna，lncrna 是一類長度大於200個核苷酸但不具備編碼蛋白質能力的分子。普遍存在於人類和各種真核生物中，lncrna具有廣泛轉錄 種類眾多 功能多樣等特點，是多種生物學過程的必需調節劑，並通過多種機制起作用。代謝組是生物體在內外調控下基因...