基因組學 實驗

登入伺服器

linux機器上登入

ssh -l public 172.28.215.241

windows機器上登入用putty客戶端

登入伺服器後請建立自己的目錄，以學號+姓名拼音命名，實驗資料和結果都放入這個目錄

設定環境變數：module add bioinfo

linux command line

生物資訊學非常有用的一行**整合

bioinformatics one-liners

基於短讀段（illumina）的基因組組裝

基於長讀段（pacbio）的基因組組裝

比較基因組學

以 全基因組 測序為目標的 結構基因組學 structural genomics 以 基因功能鑑定 為目標的 功能基因組學 functional genomics 又被稱為後基因組 postgenome 比較基因組學 comparative genomics 是基於基因 譜和測序基礎上，對已知的基因...

影像組學ibex 影像基因組學

在重要精神疾病 精神 症 抑鬱症等 關鍵基因對腦結構或腦功能的調控研究方面，我們進行了系統探索，取得了系列研究結果。1 基於擴散張量影像研究了disc1對腦結構網路的影響，發現disc1 ser704cys基因型主要調控腦結構網路的資訊傳遞效率 li et al.2013 進一步的多模態影像學研究結...

01 基因組學基本感念

轉錄本 是由一條基因 通過轉錄形成的一種或多種可供編碼蛋白質的成熟的mrna。pseudogene 假基因 pseudogene 與正常基因相似，但喪失正常功能的dna序列，往往存在於真核生物的多基因家族中，常用 表示。是基因組中與編碼基因序列非常相似的非功能性基因組 dna 拷貝,一般情況都不被轉...