在代謝組學研究中，目前最常用的分析手段是核磁共振技術（nuclear magnetic resonance, nmr）和質譜技術（mass spectrometry, ms）。在代謝組學研究中，目前最常用的分析手段是核磁共振技術（nuclear magnetic resonance, nmr）和質譜技術（mass spectrometry, ms）。
核磁共振技術nmr應用於代謝組學的研究主要有以下優點：
（1）生物樣品只需要簡單的預處理；
（2）無損傷性，不破壞樣品的結構和性質；
（3）可在接近生理條件下進行實驗。
nmr技術在代謝組學存在較大的瓶頸即靈敏度較差，因此，鑑定到的代謝物數目很有限。
質譜技術具有高選擇性和高靈敏度，能夠同時檢測多種代謝物，應用範圍廣；且通過質譜技術採集到的ms/ms譜圖能夠提供代謝物的結構資訊，有利於代謝物的結構鑑定。
同時質譜技術可方便地與分離技術（如毛細管電泳（capillary electrochrophoresis，ce）、氣相色譜（gas chromatography，gc）和液相色譜（liquid chromatophray, lc））相結合，進一步提高分析複雜樣品代謝組的能力。
毛細管電泳分離解析度較高，耗費的溶劑少，且成本較低，當其跟高靈敏度的質譜檢測器聯用時，可以得到較低的檢測限。生物機體內含有眾多極性小分子代謝產物，因此，ce-ms適用於代謝物，尤其是極性代謝物的分離分析中。
gc-ms具有標準的ms/ms譜相簿，這極大地方便了代謝物的定性分析。目前國際上常用的包含gc-ms資料的二級譜相簿有nist庫和wiley庫等，因此，gc-ms的高靈敏度以及ei譜庫的完備性使其成為代謝組學研究中被廣泛應用的較為成熟的分析方法。
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LncRNA與代謝組聯合分析
簡介 長非編碼rna long non coding rna，lncrna 是一類長度大於200個核苷酸但不具備編碼蛋白質能力的分子。普遍存在於人類和各種真核生物中，lncrna具有廣泛轉錄 種類眾多 功能多樣等特點，是多種生物學過程的必需調節劑，並通過多種機制起作用。代謝組是生物體在內外調控下基因...
代謝組學實驗 質控與分析
目錄2.資料分析挖掘 1 專案流程 代謝組學分析的特點 專案流程 樣本製備 質譜儀分析 資料預處理 定量及統計分析 定性分析 生信及後續分析 2 非靶代謝質控 質譜儀訊號波動使非靶代謝訊號隨時間漂移。原因 訊號隨時間漂移或中途裝置維護會嚴重影響多元統計分析效果，如pca中樣品分布不均勻，存在異常值。...
代謝組學 3 資料分析
1.代謝物提取，一般要求每組至少10個樣 2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為qc 3.qc樣本與實驗樣本穿插上機，開始十個qc，結尾三個qc，中間每十個樣本穿插乙個qc樣本 得到質譜譜圖資料經軟體處理後得到峰表。峰 式一般為 每行為乙個m z，每列為乙個樣本 數值表示該樣本中某個m z的訊號響應...