簡介
長非編碼rna（long non-coding rna，lncrna）是一類長度大於200個核苷酸但不具備編碼蛋白質能力的分子。普遍存在於人類和各種真核生物中，lncrna具有廣泛轉錄、種類眾多、功能多樣等特點，是多種生物學過程的必需調節劑，並通過多種機制起作用。代謝組是生物體在內外調控下基因轉錄的最終結果，是生物體表型的物質基礎和表型的直接體現者。
在系統生物學研究時代，生物發育過程複雜多變，基因調控網路複雜，單獨用一種組學對系統生物學進行研究，往往比較片面。lncrna測序資料與代謝組資料進行關聯分析，深入到調控基因以及功能基因，從原因和結果兩個層次分析生物體的內在變化，鎖定與代謝物變化重點通路，構建核心調控網路，系統全面地解析疾病發生發展的複雜機制，進而從整體上解釋生物學問題。
分析思路
關聯分析內容
kegg通路富集分析。
相關性熱圖。
相關性網路圖。
典範對應分析(cca analysis）。
o2pls模型關聯分析。
鑑定關鍵lncrna/mrna/代謝物。
代謝組學實驗 質控與分析
目錄2.資料分析挖掘 1 專案流程 代謝組學分析的特點 專案流程 樣本製備 質譜儀分析 資料預處理 定量及統計分析 定性分析 生信及後續分析 2 非靶代謝質控 質譜儀訊號波動使非靶代謝訊號隨時間漂移。原因 訊號隨時間漂移或中途裝置維護會嚴重影響多元統計分析效果，如pca中樣品分布不均勻，存在異常值。...
代謝組學 3 資料分析
1.代謝物提取，一般要求每組至少10個樣 2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為qc 3.qc樣本與實驗樣本穿插上機，開始十個qc，結尾三個qc，中間每十個樣本穿插乙個qc樣本 得到質譜譜圖資料經軟體處理後得到峰表。峰 式一般為 每行為乙個m z，每列為乙個樣本 數值表示該樣本中某個m z的訊號響應...
代謝組學分析平台都有什麼儀器？
在代謝組學研究中，目前最常用的分析手段是核磁共振技術 nuclear magnetic resonance,nmr 和質譜技術 mass spectrometry,ms 在代謝組學研究中，目前最常用的分析手段是核磁共振技術 nuclear magnetic resonance,nmr 和質譜技術 m...