bsa(bulked segregant analysis)又稱混合群體分離分析法,是利用極端性狀進行功能基因挖掘的一種方法。主要思想是將兩個具有極端性狀的群體進行混池測序,比較兩個群體在多型位點(snp)的allele frequency(af)是否具有顯著差異。以植物株高性狀為例,收集株高處於兩個極端的樣本分別混池測序,通過全基因組掃瞄,找到af具有顯著差異的位點,然後通過相關研究結果,對這些位點進行篩選,找到影響株高的功能位點。
bsa在2023年就被提出(giovannoni et al., 1991; michelmore et al., 1991),只不過當時使用的標記不是snp而是rapd和rflps等傳統標記。隨著二代測序的發展,snp標記的開發和測序成本的下降,使bsa技術成為qtl定位的有力工具。
最近在bsa技術上的出色工作,主要為日本iwate biotechnology research center的乙個團隊。他們開發出了mutmap(abe, a. et al., 2012)、qtl-seq(takagi, h. et al., 2013)、mutmap+(r fekih et al., 2013)、mutmap-gap(takagi, h. et al., 2013)等。
杜邦分析法 漏斗分析法和矩陣關聯分析法
資料分析工作涉及到很多的分析方法,比如說杜邦分析法 漏斗分析法以及矩陣關聯分析法,這些方法都是能夠幫助我們更好地進行資料分析工作。在這篇文章中我們就給大家介紹一下關於杜邦分析法 漏斗分析法和矩陣關聯分析法的相關知識,希望能夠更好地幫助大家增長見識。1.杜邦分析法 資料分析中的杜邦分析法是由美國杜邦公...
基於LR分析法的簡單分析法
一 課程設計目的 通過設計 編制 除錯乙個簡單計算器程式,加深對語法及語義分析原理的理解,並實現詞法分析程式對單詞序列的詞法檢查和分析。二 課程設計內容及步驟 本次課程設計需要使用 lr 分析法完成簡單計算器的設計,其中算術表示式的文法如下 無符號整數 數字 標誌符 字母 表示式 項 項 因子 因子...
層次分析法
ahp分析方法,其基本步驟可歸納為 1 建立遞階層次結構 建立遞階層次結構是ahp法中關鍵一步,如圖所示。首先,把複雜問題中所包含的因素分解為不同層次。同一層次的因素作為準則對下一層次的某些因素起支配作用,同時,它又受上乙個層次因素的支配。這種從上到下的支配關係形成了乙個遞階層次結構,處於最上層的是...