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在開始實驗專案之前,明確實驗流程,一步一步獲取實驗結果,以視覺化工具展現結果,並加以生物學意義上的分析,獲取完整的分析報告。下面給出菌群多樣性分析報告中應包含的大致內容,並對實驗流程做出指導性的闡述。
1.專案背景與概況
簡單闡述所研究專案的國內外現狀,本專案的目的與意義。
2.材料與方法(material and methods)
2.1原始資料測定實驗流程
2.2資料分析流程
利用原始測序資料以及樣本的分組資訊進行一系列資料分析,流程如下。
(1)序列預處理和質量控制
(2)otu劃分與分類
劃分得到樣本的otus.獲取各otu的代表序列,通過各otu所包含的reads數目,建立otu_table;用於分類level鑑定和系統發育學分析。該分析過程可用一些視覺化工具進行分析描述.
多樣性指數介紹
之前了解了shannon diversity index,所以順便補一下其他多樣性指數的概念 i am 分割線 1 species richness 系統中物種的觀察值是其真實物種豐富度的有偏估計值,並且觀察值會隨著取樣的增加非線性的增長。因此在表示 從生態系統中觀察到的物種豐富度時,s常被稱作種密...
谷歌的勞動力多樣性
一直以來,我們對谷歌的勞動力多樣性諱莫如深。現在,我們意識到這並不是乙個明智的做法,是時候談談這個話題了。簡單來說,當我們說起勞動力多樣性時,谷歌並不是乙個理想的例子,並且,如果你不是懷著一顆開放包容的心,很多問題根本無從說起。下面是谷歌勞動力多樣性的資料。出於各方面的原因,許多科技公司,比如谷歌,...
為什麼創業公司應該避免「多樣性」
上個星期我們與投資人開創業公司專案會時,其中有一位投資人這麼說 好了各位,這畢竟不是乙個科學專案。而其他參與了這家公司運營的人回答他 兄弟,這就是乙個科學專案。任何乙個創業公司都是乙個科學專案。創業公司並非大公司的縮影,創業公司通常志向遠大,前途未卜,而且人們通常不知道自己在瞎忙什麼。這就是為什麼對...