Matlab 資料降維工具箱drtoolbox

2021-09-01 06:46:42 字數 2573 閱讀 1583

drttoolbox :matlab toolbox for dimensionality reduction是laurens van der maaten資料降維的工具箱。

裡面囊括了幾乎所有的資料降維演算法:

- principal component analysis ('pca')

- linear discriminant analysis ('lda')

- independent component analysis ('ica')

- multidimensional scaling ('mds')

- isomap ('isomap')

- landmark isomap ('landmarkisomap')

- locally linear embedding ('lle')

- locally linear coordination ('llc')

- laplacian eigenmaps ('laplacian')

- hessian lle ('hessianlle')

- local tangent space alignment ('ltsa')

- diffusion maps ('diffusionmaps')

- kernel pca ('kernelpca')

- generalized discriminant analysis ('kernellda')

- stochastic neighbor embedding ('sne')

- neighborhood preserving embedding ('npe')

- linearity preserving projection ('lpp')

- stochastic proximity embedding ('spe')

- linear local tangent space alignment ('lltsa')

- ****** pca ('spca')

- conformal eigenmaps ('cca', implemented as an extension of lle)

- maximum variance unfolding ('mvu', implemented as an extension of lle)

- fast maximum variance unfolding ('fastmvu')

- autoencoders using rbm pretraining ('autoencoder')

- autoencoders using evolutionary optimization ('autoencoderea')

在此寫下我在使用中遇到的一點點小問題。

首先安裝工具箱,一般都把工具箱發到matlab預設放置工具箱的目錄matlabroot\toolbox\下面,拷貝過去之後,記得修改matlabroot\toolbox\local 下的pathdef.m檔案,要在裡面新增上新的工具箱的路徑:

matlabroot,'\toolbox\drtoolbox;', ...

matlabroot,'\toolbox\drtoolbox\techniques;', ...

注意要把子資料夾techniques也新增進入。

具體參加說明文件。

在使用『isomap』演算法時,會遇到錯誤如下:

invalid mex-file c:\program files\matlab\r2010b\toolbox\drtoolbox\techniques\dijkstra.dll 找不到指定模組

發現相應路徑中,dijkstra.dll的檔案是在的,於是以為是環境變數或者progam files空格的問題,嘗試修改均無效。

後來仔細閱讀了原始檔的注釋才發現是編譯版本問題。dijkstra函式是用c++實現的,需要用matlab的mex編譯器編譯成dll呼叫。雖然工具箱中已經有相應編譯的dijkstra.dll,但不同版本的matlab呼叫會遇到問題,需要重新編譯。

在windows命令列cmd中,用cd命令更改路徑到工具箱路徑下,執行命令:

mex -o dijkstra.cpp
編譯出現錯誤:

1) cannot open include file 'iostream.h' : no such file or directory

修改dijkstra.cpp中 include為

2) 『cout』 : undeclared identifier 『cin』 : undeclared identifier

在dijsktra.cpp中加入一行 using namespace std;

編譯成功之後,在techniques資料夾下出現dijkstra.mexw32的檔案,即為新編譯的dll。我們可以修改之前的為dijkstra.dll.old,重新命名dijkstra.mexw32為dijkstra.dll。

在matlab環境中執行isomap的程式:

成功!

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