lammps構建晶界模型1.系統晶體取向我們以構建鋁(al)的sigma3 (112),方向為x = [111],y = [112],z= [110]的晶界為例:
upper和lower兩部分晶體可以是映象對稱的。2. 勢函式部分
3. 晶界處距離的校正
純粹的幾何旋轉可能會造成晶界處的原子重疊(即原來定義的上下兩部分晶體在晶界處兩原子間距離過近),此時則可以用delete_atoms命令刪除重疊原子其中的乙個原子。這裡的距離0.25可根據情況適當調整。必要時也可使用displace_atom命令移動原子。4. 模型弛豫我們可以將建好的晶界模型用minimize命令進行弛豫,用dump命令將構型輸出。
(再選用之前教程中介紹的cna分析工具),則可看到晶界模型如下圖所示。
另外:模擬系統初始化部分這裡省略了,重複的同學注意下。如果對其中的命令理解還是很困難的話,可以考慮結合lammps手冊回顧一下我們之前的教程~
今天就先介紹到這裡~歡迎各位關注和投稿([email protected])~覺得內容對您有幫助的話,麻煩點個在看(廣告)鼓勵下,謝謝~
lammps建模 LAMMPS命令建模模板的完善
前幾天參考eric n.hahn大神的in檔案內的石墨烯建模發了乙個lammps命令建模模板的推文,由於本人太懶,沒仔細檢查,不好意思了 後面提醒,其中的c原子的排列規則定義有問題,形狀沒問題但是c c之間的距離卻遠小於1.4埃,後經過檢測,發現這是由於沒有加units metal指令,而lammp...
lammps建模 LAMMPS常用建模方法總結
建模是進行材料模擬的第一步,這裡對lammps常用的建模方法進行總結 我平時用到的,難免不全面 概況來說,建模方法有兩種 內部建模和外部建模。內部建模 內部建模,即使用lammps提供的命令建立模型。這種方法主要用於構建比較簡單和標準的體系。lattice 定義晶格型別 region 定義模擬盒子的...
LAMMPS應用 LAMMPS模擬衝擊壓縮
衝擊波通常是由 或巨集觀物體的高速碰撞產生的,如炸藥 高速彈丸穿甲,隕石撞擊等。衝擊波作用下材料在極短時間內發生塑性形變 熔化或化學反應等本質上不可逆的變化。衝擊載荷相關的空間尺度 如晶格層次形變 和時間解析度 皮秒至飛秒量級 都非常適合於通過md模擬進行研究。下面簡要介紹如何使用md軟體lammp...