我是生物工程專業出身,在大三保研時選擇了生物資訊的道路,到現在為止已經在行業裡摸爬滾打了6年的時間,在這6年的學習之路上疑惑過,也迷茫過,特此把我學習的過程以及遇到的問題總結出來以讓大家避免出現同樣的問題。在我學習生物資訊過程的基礎上帶著大家順暢的走一遍。在學習生物資訊學之前,我們先來了解一下什麼是生物資訊學。
生物資訊學,顧名思義,生物學和資訊學的結合。生物學,這個對大家比較簡單,基本入生信行的同學大部分是有生物學背景的,這個在生物資訊學的學習中不需要過多強調,但需要更深入的了解一些測序有關的原理。資訊學,可以理解為計算機,我們拿到了我們的基因組,轉錄組或者蛋白組資料之後,怎麼從這些龐大的資料中找出某些生物學關係呢,這就需要計算機幫我們快速的實現了。生物資訊學就是一門以計算機來幫我們解決生物學問題的科學。
生物資訊學的學習過程有一部分的時間是要學習程式語言和各種軟體的。前面介紹了生物學知識我們基本了解,那如何來學習程式語言吶?自學程式設計,其實是個很簡單的問題,我們有一些資料,希望資料經過一定的處理得到理想的結果。生物資訊中的資料文字處理相對來說很簡單,簡單的幾個需求:1,在乙個資料文字中挑選出部分行或列,如挑出表達值大於多少的基因。2.兩個或多個資料文字的比較,如乙個基因列表file1,另乙個全基因的表達值表file2,把file1**現在file2中的基因及表達值取出。下面會有章節詳細的介紹,打江山容易守江山難,學起來容易堅持下來難,所以對於自學來說最困難的是堅持下來,堅持著學下去並且在實戰中進步。
生物資訊學(Bioinformatics)
生物資訊學 bioinformatics 這個名詞有許多不同的定義。從字面上來看,生物資訊學是將資訊科學應用於生物學。生物資訊學廣義的概念是指應用資訊科學研究生物體系和生物過程中資訊的存貯 資訊的內涵和資訊的傳遞,研究和分析生物體細胞 組織 器官的生理 病理 藥理過程的中各種生物資訊,或者說是生命科...
生物資訊學緒論
hgp第乙個五年總結報告 生物資訊學是一門交叉學科 它包含了生物資訊的獲取 加工 儲存 分配 分析 解釋等在內的所有方面,它運用數學 電腦科學和生物學的各種工具闡明和解釋大量資料所包含的生物學意義。美國喬治亞理工大學 生物資訊學是採用數學 統計學和電腦科學,分析生物學 生物化學和生物物理學資料的一門...
生物資訊學 之 fastQ
fastq格式 是儲存核酸序列及其測序質量得分資訊 由單個asc 字元表示的文字格式,是當前儲存高通量測序結果的事實標準。fasta格式 r寫入 library biostrings s readdnastringset name.fasta readbstringset filepath,form...