生物資訊學(bioinformatics)這個名詞有許多不同的定義。從字面上來看,生物資訊學是將資訊科學應用於生物學。生物資訊學廣義的概念是指應用資訊科學研究生物體系和生物過程中資訊的存貯、資訊的內涵和資訊的傳遞,研究和分析生物體細胞、組織、器官的生理、病理、藥理過程的中各種生物資訊,或者說是生命科學中的資訊科學。狹義的概念是指應用資訊科學的理論、方法和技術,管理、分析和利用生物分子資料。一般提到的「生物資訊學」是指這個狹義的概念,更準確地說,應該是分子生物資訊(molecular bioinformatics)。
生物資訊學是二十世紀80年代末隨著基因組測序資料迅猛增加而逐漸形成的一門交叉學科。隨著生物學和醫學的迅速發展,特別是人類基因組計畫的順利推進,產生了海量的生物學資料,特別是生物分子資料的積累速度在不斷地快速增加。這些資料具有豐富的內涵,其中隱藏著豐富的生物學知識。充分利用這些資料,通過資料分析、處理,揭示這些資料的內涵,得到對人類有用的資訊,這將是生物學家和數學家所面臨的乙個嚴峻的挑戰。生物資訊學是為迎接這種挑戰而發展起來的乙個交叉學科。
根據美國nih和doe在2023年給出了生物資訊學的定義,它是生物學與電腦科學以及應用數學等學科相互交叉而形成的一門新興學科。它通過對生物學實驗資料的獲取、加工、儲存、檢索與分析,進而達到揭示資料所蘊含的生物學意義的目的。當前生物資訊學發展的主要推動力來自分子生物學,生物資訊學的研究主要集中在核苷酸序列的儲存、分類、檢索和分析等方面。目前,生物資訊學可以狹義定義為:將電腦科學和數學應用於生物大分子資訊的獲取、加工、儲存、分類、檢索與分析,以達到理解這些生物大分子資訊的生物學意義的交叉學科,並服務於人類健康事業——藥物開發、基因診斷、**等。下圖說明了生物資訊學在生命科學與計算機、數學之間的關係,它不是在兩者之間起著橋梁作用,而是充分利用各種方法和手段從海量的生物學資料中發現生物學知識,它需要對兩者進行整合和交叉。
生物資訊學研究是利用數理統計、模式識別、動態規劃、密碼解讀、語意解析、信令傳遞、神經網路、遺傳演算法以及隱馬氏模型等各種方法,對序列、結構資料進行定性和定量分析,從中獲取基因編碼、基因調控、序列-結構-功能關係等理性知識,闡明細胞、器官和個體的發生、發育、病變、衰亡的基本規律和時空聯絡,探索生命起源、生物進化、生命本質等重大理論問題,最終建立「生物學週期表」。
生物資訊學軟體 自學生物資訊學
我是生物工程專業出身,在大三保研時選擇了生物資訊的道路,到現在為止已經在行業裡摸爬滾打了6年的時間,在這6年的學習之路上疑惑過,也迷茫過,特此把我學習的過程以及遇到的問題總結出來以讓大家避免出現同樣的問題。在我學習生物資訊過程的基礎上帶著大家順暢的走一遍。在學習生物資訊學之前,我們先來了解一下什麼是...
生物資訊學緒論
hgp第乙個五年總結報告 生物資訊學是一門交叉學科 它包含了生物資訊的獲取 加工 儲存 分配 分析 解釋等在內的所有方面,它運用數學 電腦科學和生物學的各種工具闡明和解釋大量資料所包含的生物學意義。美國喬治亞理工大學 生物資訊學是採用數學 統計學和電腦科學,分析生物學 生物化學和生物物理學資料的一門...
生物資訊學 之 fastQ
fastq格式 是儲存核酸序列及其測序質量得分資訊 由單個asc 字元表示的文字格式,是當前儲存高通量測序結果的事實標準。fasta格式 r寫入 library biostrings s readdnastringset name.fasta readbstringset filepath,form...