生物資訊學是一門發展非常迅速的新興學科,其分析軟體和流程在不斷完善當中。業內經常舉辦一些「競賽」。組織者獲得一些問題的金標準「真相」,如組裝乙個基因組或評估變異檢測流程的準確性等,然後邀請業界內成員在一定時限內來競爭解決這些問題。通過比較基於不同方法的結果,組織者可以評估每一種方法的效能,即真陽性和假陽性,真陰性和假陰性,並通過定義靈敏度和特異性來了解選用何種工具。一些競賽案例如下。
alignathon——比較基因組比對方法
egasp——encode 基因組注釋評價專案
assemblathon——比較基因組組裝軟體的效果
gage——基因組組裝金標準評價
abrf——生物分子資源設施組織(abrf)磷酸化評估
casp——結構**的重要評估
cafa——蛋白功能的重要評估
cagi——基因組解釋的重要評估
giab——瓶中基因組計畫
precisionfda truth challenge——精準 fda 真理挑戰賽
生物資訊學軟體 自學生物資訊學
我是生物工程專業出身,在大三保研時選擇了生物資訊的道路,到現在為止已經在行業裡摸爬滾打了6年的時間,在這6年的學習之路上疑惑過,也迷茫過,特此把我學習的過程以及遇到的問題總結出來以讓大家避免出現同樣的問題。在我學習生物資訊過程的基礎上帶著大家順暢的走一遍。在學習生物資訊學之前,我們先來了解一下什麼是...
生物資訊學(Bioinformatics)
生物資訊學 bioinformatics 這個名詞有許多不同的定義。從字面上來看,生物資訊學是將資訊科學應用於生物學。生物資訊學廣義的概念是指應用資訊科學研究生物體系和生物過程中資訊的存貯 資訊的內涵和資訊的傳遞,研究和分析生物體細胞 組織 器官的生理 病理 藥理過程的中各種生物資訊,或者說是生命科...
生物資訊學緒論
hgp第乙個五年總結報告 生物資訊學是一門交叉學科 它包含了生物資訊的獲取 加工 儲存 分配 分析 解釋等在內的所有方面,它運用數學 電腦科學和生物學的各種工具闡明和解釋大量資料所包含的生物學意義。美國喬治亞理工大學 生物資訊學是採用數學 統計學和電腦科學,分析生物學 生物化學和生物物理學資料的一門...