最近一直在幫師姐根據snp找基因組上的酶切多型位點，然後給她提供該位點附近1kb的序列，讓她去設計引物。由於我本科就做過一點點的遺傳定位，當時用的是sscp(單分子構象多型性)去區分單個鹼基差異，所以我對snp分子比較的檢測方法就侷限在高通量測序和sscp而已。然後今天猛然聽師兄說他要用dcaps來根據snp位點對群體進行基因型鑑定，我才開始去找相關的概念，去找/造輪子用。
dna序列上幾個鹼基的差異會影響限制性內切酶的有無。最開始用rflp來鑑定這種酶切多型性位點，但是需要設計放射性的探針，有點風險。後來有了pcr技術，就可以設計目標位置附近的引物進行擴增，然後使用特定的限制性內切酶進行酶切，之後通過電泳跑膠根據條帶的長度來判斷基因型。
dcaps聽名字就知道和caps有很大的關係, 它使用存在幾個鹼基錯配的pcr引物對目標區間進行擴增，從而引入酶切位點或者破壞酶切位點，之後根據條帶長度來鑑定基因型。
dcaps示例: **於ncbi
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