生物資訊及開發常用的Linux命令

2021-08-18 22:29:25 字數 991 閱讀 9714

1.ls 檢視當前目錄下有哪些檔案或目錄;

-lh 顯示當前目錄下的所有檔案和目錄及其大小

-l   詳細顯示當前目錄下的所有檔案和目錄,還有三種許可權關係

如圖所示,d 表示目錄;- 表示檔案 ,後面每三個字母為一組,分別表示檔案或目錄所有者擁有的許可權,檔案或目錄所有者同組成員所擁有的許可權,其他人的許可權。r:可讀(可用數字4表示),x:可執行(1),w:可寫(2);可讀即可以看,可以複製,可寫則可以改變,可執行則可以執行等操作;

ps:用chmod可以改變許可權,如:chmod 755 1.txt  >>  將檔案1.txt改為檔案所有者可讀可寫可執行,同組成員可讀可執行,其他人可讀可執行。

2.qsub提交作業:

qsub -cwd -v -l h_vmem=30g -q meta.q -pe smp 8 qsub.sh;    

注意qsub.sh裡面必須是可執行的命令指令碼。 

ps:通過qdel id 終止程序;qstat 檢視當前使用者提交的任務執**況;qstat -u "*"檢視所有節點任務執**況

3.nohu 命令 &,後台提交命令到後台執行,不會因為伺服器問題而使得命令執行中斷,但是有個問題就是無法通過kill 程序號殺死,只能通過pkill -u 使用者名稱    終止此使用者所有程序

4.vim替換命令:替換所有行的內容:      :%s/from/to/g

5.tomcat 檢視日誌:

[root@localhost tomcat]# tail -f logs/catalina.out

6.網路埠命令:

netstat -antp|grep svn    :檢視svn埠

svnserve -d -r /usr/local/svnreposity/sharewx  啟動svn

vim配置檔案:                                

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