sra是ncbi 推出的儲存高通量資料的格式，而平常我們工作用得多是fastq格式。如果需要把sra 轉成fastq
sratoolkit.2.1.16-centos_linux64，解壓就可以用
sratoolkit.2.1.16-centos_linux64/bin/fastq-dump
然後使用如下命令列：
/data/safe/soft/sratoolkit.2.1.16-centos_linux64/bin/fastq-dump srr034580.sra
這樣就可以很簡單的把sra格式轉成fastq格式了。
基因測序與高通量測序區別
基因測序是一種新型基因檢測技術，能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列，罹患多種疾病的可能性，個體的行為特徵及行為合理，如癌症或白血病，運動天賦，酒量等。基因測序相關產品和技術已由實驗室研究演變到臨床使用，可以說基因測序技術，是下乙個改變世界的技術。普通的基因測序 指 常規dna測序 是用sanger...
高通量測序中常見名詞解釋
m 常用於描述reads 的數量。例如 10m 就是 10 10 6 條reads g 常用於描述這一批次測序共有的鹼基數量。例如 10g 就是10 10 9個鹼基 比如說對於3g測序量的理解 3g指有 5 10 9 個鹼基，假如採取illumia的pe150測序，即150bp雙端測序，算有多少m測...
國內高通量植物單細胞轉錄組文章
三個關鍵字，國內，高通量和轉錄組 乙個網頁工具 2019年4月18日，國內第一篇植物根部單細胞轉錄組文章在 molecular plant 發表，題為 a single cell rna sequencing profiles the developmental landscape of arabi...