r bioconductor中的scrnaseq
資料報是專門提供scrna-seq資料的包。
scrna-seq
包提供了乙個方便的途徑來獲得公開的資料集,這些資料集是以singlecellexperiment
格式儲存的。
library(singlecellexperiment)
library(scrnaseq)
fluidigm <- reprocessedfluidigmdata()
fluidigm
檢視表達資料矩陣:
assay(fluidigm)
可獲得的資料集可以分為兩類,第一類包含表達矩陣,由scrnaseq作者從每個實驗得到的原始
測序資料產生的,這些包括:
暫時用不上,略
R語言常用資料探勘包
今天發現乙個很不錯的部落格 博主致力於研究r語言在資料探勘方面的應用,正好近期很想系統的學習一下r語言和資料探勘的整個流程,看了這個部落格的內容,心裡久久不能平靜。決定從今天開始 今天發現乙個很不錯的部落格 博主致力於研究r語言在資料探勘方面的應用,正好近期很想系統的學習一下r語言和資料探勘的整個流...
R語言常用資料探勘包
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基於R的資料探勘的包
聚類 常用的包 fpc,cluster,pvclust,mclust 基於劃分的方法 kmeans,pam,pamk,clara 基於層次的方法 hclust,pvclust,agnes,diana 基於模型的方法 mclust 基於密度的方法 dbscan 基於畫圖的方法 plotcluster,...