總結個人關於《r語言與bioconductor 生物資訊學應用》的一些摘錄，方便自己日後查閱。
如何用最精簡的語言來概括生物資訊學（狹義的）主要工作，那就是注釋、統計和視覺化。這裡的注釋是指通過電腦程式自動化批量注釋，它往往是資料處理的第一步；統計基於多條序列注釋的結果；視覺化貫穿整個資料的處理過程，是生物資訊學的乙個重要組成部分。廣義的生物資訊學還可以涉及更多的方向，如資料庫構建和資料探勘領域、計算機生物學領域（**結構**和藥物對接）和系統生物學等。 舉例來說，如果你通過測序得到一條dna序列，首先要做的就是比對到公共資料庫（即相似性搜尋），找到它的相似序列，得到這條相似序列的功能和結構等各類資訊。基因組或轉錄組序列的注釋包括基因識別和基因功能注釋兩個方面。基因識別的核心是確定全基因組序列中所有基因（包括編碼區、調控區、5』端未翻譯區和 3』端未翻譯區等）的確切位置。主要有兩種方法：一是通過相似性比對從已知基因和蛋白質序列得到間接證據；二是基於各種統計模型和演算法從頭**。對從頭**出的基因進行高通量功能注釋也是基於相似性搜尋。
本書的關於生物資訊學基礎知識就到這裡。
生物資訊學基礎知識Day2
總結個人對 r語言與bioconductor 生物資訊學應用 作的一些摘要。方便自己日後查閱。dna測序技術 dna sequencing 簡單來說就是確定四種核苷酸殘基 a t c和g 的排列順序。第一代測序技術，也稱sanger測序法 第二代測序技術，也稱深度測序或高通量測序 第三代測序的核心概...
生物資訊學軟體 自學生物資訊學
我是生物工程專業出身，在大三保研時選擇了生物資訊的道路，到現在為止已經在行業裡摸爬滾打了6年的時間，在這6年的學習之路上疑惑過，也迷茫過，特此把我學習的過程以及遇到的問題總結出來以讓大家避免出現同樣的問題。在我學習生物資訊過程的基礎上帶著大家順暢的走一遍。在學習生物資訊學之前，我們先來了解一下什麼是...
生物資訊學（Bioinformatics）
生物資訊學 bioinformatics 這個名詞有許多不同的定義。從字面上來看，生物資訊學是將資訊科學應用於生物學。生物資訊學廣義的概念是指應用資訊科學研究生物體系和生物過程中資訊的存貯 資訊的內涵和資訊的傳遞，研究和分析生物體細胞 組織 器官的生理 病理 藥理過程的中各種生物資訊，或者說是生命科...