生物通路是細胞內分子之間的一系列相互作用，會導致細胞內的產生某種產物或某種改變。這種通路可以觸發新的分子如脂肪或蛋白質的組裝。通路也可以開啟或關閉基因，或者刺激細胞移動。一些最常見的生物通路涉及到代謝、基因表達調控和訊號傳導。通路在基因組學的高階研究中起著關鍵作用。
通路資訊可以從大量資料庫獲得，包括從專業校對過的高質量資料庫和通過對文章摘要進行自然語言處理和文字挖掘產生的大量假定通路的資料庫。由於不同資料庫大小、質量和屬性不同，使用者需要根據自己目的選擇使用正確的資料庫。
kegg (kyoto encyclopedia of genes and genomes) (位址見文末)是由京都大學生物資訊學中心和東京大學人類基因組中心共同開發的一系列資料庫。正如名字百科全書所暗示的，資料庫包括系統理解生物學所必需的資訊，如基因組序列和化學資訊。kegg許可證由path solutions inc.**(位址見文末/)。
kegg的獨特之處在於其對酵母、小鼠和人類代謝通路的關注和覆蓋。目前，細胞週期和凋亡的訊號通路正在擴充套件。閱讀和總結相關文獻的專業人士持續更新通路資訊。資料庫以keggml的格式儲存。由於通路隨後顯示為gif檔案，使用者無法輕鬆編輯通路資訊。但可以借助第三方工具進行編輯和展示。51xxziyuan.com
biocyc是sri國際提供的通路資料庫(位址見文末)。該資料庫最初由sri國際生物資訊學研究小組建立，是乙個專注於代謝通路的高質量資料庫。與biocyc相關的有ecocyc、metacyc、humancyc資料庫。許可證對學術和非營利組織都是免費的。人類和大腸桿菌是主要的生物體，還有其他各種生物體。ecocyc主要是大腸桿菌代謝通路的資料庫，用化學方程式的形式顯示。ecocyc也包含少量的訊號通路。策展人從文獻中提取了通路知識。使用專用格式描述通路。
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