大家都知道,基因可以看作乙個鹼基對序列。它包含了44種核苷酸,簡記作a,c,g,ta,c,g,t。生物學家正致力於尋找人類基因的功能,以利用於診斷疾病和發明藥物。
在乙個人類基因工作組的任務中,生物學家研究的是:兩個基因的相似程度。因為這個研究對疾病的**有著非同尋常的作用。
兩個基因的相似度的計算方法如下:
對於兩個已知基因,例如agtgatgagtgatg和gttaggttag,將它們的鹼基互相對應。當然,中間可以加入一些空鹼基-,例如:
這樣,兩個基因之間的相似度就可以用鹼基之間相似度的總和來描述,鹼基之間的相似度如下表所示:
那麼相似度就是:(-3)+5+5+(-2)+(-3)+5+(-3)+5=9(−3)+5+5+(−2)+(−3)+5+(−3)+5=9。因為兩個基因的對應方法不唯一,例如又有:
相似度為:(-3)+5+5+(-2)+5+(-1)+5=14(−3)+5+5+(−2)+5+(−1)+5=14。規定兩個基因的相似度為所有對應方法中,相似度最大的那個。
輸入格式:
共兩行。每行首先是乙個整數,表示基因的長度;隔乙個空格後是乙個基因序列,序列中只含a,c,g,ta,c,g,t四個字母。1 \le1≤序列的長度\le 100≤100。
輸出格式:
僅一行,即輸入基因的相似度。
輸入樣例#1:複製
7 agtgatg輸出樣例#1:複製5 gttag
14dp :opt[i][j]代表 s1[1~i] 和 s2[1~j] 的匹配度
#include#define m 105
#define inf -0x3f3f3f3f
using namespace std;
int a[m],b[m],opt[m][m],n,m;
const int v[6][6]=//建立對映
, ,,,
,};int read()//轉化
}int main()
cout<
return 0;
}
洛谷P1140 相似基因
大家都知道,基因可以看作乙個鹼基對序列。它包含了4種核苷酸,簡記作a,c,g,t。生物學家正致力於尋找人類基因的功能,以利用於診斷疾病和發明藥物。在乙個人類基因工作組的任務中,生物學家研究的是 兩個基因的相似程度。因為這個研究對疾病的 有著非同尋常的作用。兩個基因的相似度的計算方法如下 對於兩個已知...
洛谷P1140 相似基因
本題一看就知道是一道動歸,其實和字串距離非常的像,只不過多了題目規定的匹配相似度罷了。int shuzu 6 6 ps 換行效果更佳。int start char c 然後直接在主函式中呼叫即可 for int i 0 i其中s1,s2均為讀入的字串,我們把它們分別逐字元轉化放入a,b陣列。for ...
洛谷P1140 相似基因
本題一看就知道是一道動歸,其實和字串距離非常的像,只不過多了題目規定的匹配相似度罷了。int shuzu 6 6 ps 換行效果更佳。int start char c 然後直接在主函式中呼叫即可 for int i 0 i其中s1,s2均為讀入的字串,我們把它們分別逐字元轉化放入a,b陣列。for ...