參考文獻：
基於網際網路的常用化合物活性資料庫簡介
藥物靶點資料庫的應用進展_龐曉叢_劉艾林_杜冠華
1、chembl資料庫：
這裡我們將給大家介紹，如果通過pipeline pilot來自動獲取chembl資料庫中的資料，從而將查詢到的靶點或化合物的活性資料直接後續的定量構效關係（qsar）、藥效團、分子對接等藥物分析中。
chembl資料庫通過web service，為使用者提供了豐富的查詢介面，可以進行各種資訊的查詢：如查詢化合物的影象，活性資訊，相似搜尋，子結構搜尋；靶點的活性資訊，序列；分析測試的文獻資訊等。
圖1 chembl的化合物的子結構搜尋查詢語法
圖2 pipeline pilot進行chembl的化合物的相似性搜尋和根據靶點查詢
2、ctd資料庫
mount desert island biological laboratory已經公開了「比較毒物遺傳學資料庫」（comparative toxicogenomics database，**是：比較毒物遺傳資料庫）構建的目的是促進了解環境化合物對人類健康的影響。ctd首次為全世界的研究人員提供了集中、綜合的各種不同型別分子以及來自各種生物體的毒理學資料。
到目前為止，人們越來越接受這樣乙個觀點：許多疾病都與環境因子和基因的相互作用有關。這個實驗室的研究人員整合了來自各種生物的關鍵資料（例如基因序列、化合物和比較參考），從而提供了乙個有關基因－化合物相互反應的比較透檢視。這種「透檢視」對理解化合物產生毒性的分子機制至關重要。
這個透檢視還在毒性**方面起到重要作用。已經有研究證明即使是親緣關係非常近的物種對接觸到的化合物也能產生極不相同的反應。ctd提供的資料將促使人們深入了解這些差異的遺傳基礎。
ctd在mdibl建立，這個專案的主要參與者包括mdibl的james l boyer博士和john n. forrest博士以及carolyn j. mattingly博士和glenn t. colby等。
資料庫 資料庫索引
索引是儲存引擎用於快速找到記錄的一種資料結構。索引以檔案的形式儲存在磁碟中。索引可以包含乙個或多個列的值。儲存引擎查詢資料的時候，先在索引中找對應值，然後根據匹配的索引記錄找到對應的資料行。1.b tree索引 2.雜湊索引 myisam和innodb儲存引擎 只支援btree索引，也就是說預設使用...
資料庫 資料庫正規化
關聯式資料庫的設計規範。不同的規範要求被稱為不同的正規化，越高的正規化資料庫冗餘越小。減少資料庫中資料冗餘的過程 1 第一正規化 1nf 在關係模式r中，當且僅當所有屬性只包含原子值，即每個分量都是不可再分的資料項，則稱r滿足1nf。例如表所示的教師職稱情況關係就不滿足1nf。原因在於，該關係模式中...
資料庫 資料庫基礎
什麼是sql 結構化查詢語言 structtured query language sql的作用 啟動mysql.exe，連線伺服器後，就可以使用sql來操作伺服器了。類似php中操作mysql的語句就是sql語句 sql標準 由國際標準化組織 iso 制定的，對dbms 資料庫管理系統 的統一操作...