-->關於要不要使用samtools來進行格式轉換
在中指出，希望使用seq-format-conversion來代替使用samtools進行格式轉換。
理由有如下兩點：
1.samtools1.3由於在包中含有老版本的htslib，導致會生成不正確的bins
2.samtools1.4和1.5有乙個nm的問題，以至於無法和picard一起有效使用
-->gatk4.0在使用給定例項的時候，需要預先安裝有cromwell
cromwell的版本要求可能會有所不同，一些給出的gatk4.0的例項中對cromwell的使用版本號具有一定的要求
gatk過濾 GATK使用方法詳解（變異檢測）
3.怎麼解釋variation id variant的id。比如在dbsnp中有該snp的id，則會在此行給出 若沒有，則用 表示其為乙個novel variant。ref 和 alt 參考序列的鹼基 和 variant的鹼基。qual phred格式 phred scaled 的質量值，表 示在該...
python 學習雜記
一 模組匯入問題 如果在機器上安裝了多個版本的python，往往會有匯入錯誤，例如一般的python程式頭都寫的是 usr bin env python 這個實際是 usr bin python 但是如果新版本的python是後安裝的，且沒有 prifex usr 可能這個鏈結仍指向老版本pytho...
Python學習雜記
學習資料 python核心程式設計 第二版 class c object foo 100 name 是給定類的字元名字，它適用於那種只需要字串 類物件的名字 而非類物件本身的情況。內建的型別也有這個屬性。type 123 str type 123 name str type type 123 typ...