一．本文講了什麼問題？
癌症是由一系列遺傳變異和環境干擾的複雜互動作用引起的，但過去的研究很少關注遺傳變異、基因表達和microrna的變化是怎樣整合形成網路一起作用並最終導致一系列複雜表型例如腦瘤的發生；因為整合各種型別的資料、揭示癌症發生的機制仍然是乙個難題。
二．解決問題的方法
1.本文以癌症基因**譜專案（tcga）裡的資料為研究基礎，使用lasso(最小絕對縮減和變數選擇)演算法結合高斯網路模型來推斷基因共表達網路；並對複雜的遺傳網路進行分析，研究網路的健壯性及其在遺傳和環境干擾下的行為。
2.拷貝數變化（cnv）是基因組上一段區域長度約為1kb~3mb的重複或確實，被認為是癌症發生的重要風險因子，也是通過腫瘤樣本和癌旁正常組織樣本資料對比來進行分析。
三．本文一些缺點
不知道snp、cnv、甲基化位點或mirna這些在構建網路時是怎麼降維的，降維是否有效，降維後能否還原。
線粒體和葉綠體的基因組特點 基因和基因組
基因 gene 是能夠編碼蛋白質或者rna等具有特定功能產物的 負載遺傳資訊的基本單位，即有遺傳效應的dn 段 可以理解為 gene protein rna mrna trna rrna 基因組 genome 是指乙個生物體內所有遺傳物質的總和，對於含有線粒體或者葉綠體等結構的生物來說，還包括其中的...
人基因組（一）
人類基因組包含22條染色體和1條x或者y染色體，這些染色體長度為45 279mb，加起來共為3286mb。基於染色體的結構，全部基因可被分為常染色質 euchromatin 區域 通常包含活性基因 和異質染色質 heterochromatin 區域，後者攜帶低密度的活性基因。常染色質組成了基因組的主...
基於基因組資料的癌症亞型發現聚類研究
本文講了什麼問題？當今全球社會癌症頻發，嚴重威脅著人類的生存質量 不僅癌症的種類越來越多，每一種癌症也衍生出很多亞型，導致我們很難去找到一種 癌症的方法。例如一種針對肺癌的藥物色瑞替尼膠囊，它僅對1 左右的肺癌有很好的效果，因為它僅針對alk基因突變，但實際統計中只有3 5 的肺癌患者是由alk基因...