大型單細胞資料分析解決方案

2021-10-25 16:10:21 字數 438 閱讀 8466

因為單細胞資料在呈指數增長,遇到大資料集只是早晚的問題。曾經我們困惑乙個物種的基因組那麼大,如果給很多物種都測基因組的話,拿什麼來儲存這些資料?隨著單細胞技術的成熟,測序成本的下降,眼見單細胞資料通量將會呈現超指數增長。在bulk時代所幾十例轉錄組會覺得已經做了很多了,而單細胞時代少則幾千大則百萬的資料量。我們不能怪時代太快,只能怪自己沒有做好心理準備。

資料驅動

如今在生命科學研究正規化裡,有了資料驅動(data-driven)的選項。那麼,什麼是資料驅動的呢?這一概念源於現代技術的進步,不斷帶來大量系統、全面和深入的資料。當正規化改變時,資料驅動新的科學發現,而不是相反。能夠利用現有資料的研究人員能夠挖掘出意想不到的、不可**的關係和新知識。與此同時,計算能力、機器學習、人工智慧和其他可用來處理這些資料的技術已經顯著提高,並為那些成功將資料與自己的工作聯絡起來的人提供了巨大的機會。

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Hemberg lab單細胞轉錄組資料分析(二)

開發scrna seq的新實驗方法和操作手冊是目前很火的研究領域,而且最近這些年已經發表了一些改進方法。上圖可以看出檢測的細胞數目以指數形式增加,以下是乙份不完全的列表 總體流程如下圖所示 這些方法可以用不同的方式分類,但兩個最主要的優化是 定量和捕獲。定量有兩種型別 全長型和標籤型 tag bas...

單細胞轉錄組測序技術及各類資料分析方法總結

自從2009年單細胞轉錄組測序 single cell rna seq,scrna seq 技術首次問世,至今已經有幾十種不同的scrna seq技術相繼被開發出來。在過去的十年裡,單細胞轉錄組測序技術得到了蓬勃的發展,從而使得可在單細胞水平揭示全基因組範圍內所有基因的表達情況,可以更精準的開展細胞...

澳門博彩業資料分析解決方案

自2001年12月31日澳門幸運博彩專營合約期滿之後,澳門博彩業已經發展成為 三家正牌,三家副牌 共六家公司參與激烈競爭的局面,而亞洲各國和周邊地區博彩業的規劃與發展則使競爭的程度進一步加劇。近幾年來,全球經濟危機及內地在巨集觀經濟調控及簽證政策調整等方面的舉措,使博彩公司面臨經營管理的巨大挑戰。博...