常規轉錄組是我們最常接觸到的一種高通量測序資料型別，其實驗方法成熟，花費較低，是大部分cns必備的技術，以後應該就如做個pcr一樣常見。而且分析思路簡潔清晰，是入門生信，學習生信分析思路和資料視覺化的首選。
資料分析是相通的，通過乙個簡單的課程理解其中的原理，就可以推而廣之，延伸到其它型別的資料分析，如擴增子、巨集基因組、單細胞等。
第十一期高階轉錄組分析和r資料視覺化於2020-02-28 到 2020-03-01在北京鼓樓開班，將系統講述基於和不基於比對的轉錄組分析流程，從原始資料到表達矩陣、差異基因、可變剪接、富集分析、加權共表達網路、通路分析、視覺化繪圖等一系列常見操作，理論和實踐兼備。
編號內容
簡介01
預習linux基礎
02預習r基礎
03軟體安裝
11轉錄組概述
轉錄組設計、應用、批次效應等
12轉錄組分析流程簡介
基於/不基於比對的分析流程講演
13salmon定量實戰
不基於比對直接定量基因和轉錄本的表達
14差異基因分析
deseq2多組差異基因分析和結果視覺化
15go富集分析和視覺化
泡泡圖、熱圖、網圖
16gsea富集分析和視覺化
分組和時間序列gsea
21二代三代測序原理介紹
建庫測序過程及注意事項
22r基礎
資料讀寫、處理、轉換
23r資料視覺化
常見圖形繪製實戰
24linux基礎
詳細解釋linux**和檔案格式轉換
25轉錄組環境配置
linux下軟體安裝、配置
26文章常見圖表解讀
illustrator製作cns標準圖版
31可變剪接分析
star，stringtie，rmats，i**
32可變剪接分析
star，stringtie，rmats，i**
33wgcna基因加權共表達
網路分析和性狀關聯
34cytoscape繪製
共表達網路和調控通路網路圖
35每人乙個問題環節
自評學習效果、知識點回顧
41答疑-線上
答疑、考試內容串講
該課程為第11期，整個過程都比較成熟，可以在最短時間學習最多知識。
教程內容簡介如下：
轉錄組學實驗設計和測序原則、注意事項
二代、三代測序過程和原理解析
轉錄組學文章案例分析
測序資料質量評估和清洗
不基於比對的差異基因分析
基於比對的差異基因分析
轉錄本組裝和選擇性剪接分析
目標基因gsea/go富集分析
wgcna基因、表型關聯分析
cytoscape 共表達網路繪製
kegg/reactome通路圖繪製，表達對映
基因互作的文獻挖掘和資料庫挖掘展示
在培訓上，結合發表高水平文章，進一步講解16種常用分析圖的原理和使用範圍，讓你不僅讀懂圖，更知道如何應用於自己的研究，並親自輕鬆完成繪圖。
linux/windows下rstudio和linux命令的使用
linux/windows下轉錄組分析流程的搭建
生物學家必要掌握的shell和r語言基礎知識。
(如果基礎薄弱，報名付款成功後，可免費領取基礎程式課，做好準備工作, 讓程式成為我們的得力工具而不是學習新知識的絆腳石。)
如果您看到文章中有哪些圖或分析工作需要重現，也請提出，一起講述。
如果您有其它關注的問題，也請報名時提出，把這次課程變成您的定製講解。
120分的轉錄組試題(第乙份答案)
120分的轉錄組試題(第二份答案)
120分的轉錄組試題(第三份答案)
本課程以講解流程和實際操作為主，採用獨創四段式教學，封裝好的**全部分享，隨處可用：
2020-02-28 到 2020-03-01 (線下講解實戰)
每天早9點到晚6點，半封閉式教學 (最後1小時為集中討論時間，最後一天會稍微提前一些，多留出時間討論，也方便老師乘車返回)
北京市西城區鼓樓附近(鼓樓地鐵站周邊1公里)。
名額有限，每次課程報名滿40人後自動關閉報名通道
提供易漢博基因科技實習機會或工作機會
座位按報名並繳費或預付款成功順序從前到後龍擺尾式排序
贈送價值99元程式基礎課乙份 (
.com)
多人 (n，10>n>1) 組團報名並同時繳費，每人還可減免n-1百元 (最高500)
贈送金士頓u盤乙個(32g含培訓資料和指令碼)
易生信同時推出多門相關課程，連報優惠——同時選2門課，95折；三門課9折，4門及以上85折。還可與**同時優惠！擴增子(專案初探)+巨集基因組(高精尖)，祝你分析水平更上一層樓。
免費獲得價值3998元的線下課程錄屏(有效期一年)
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轉錄組分析 轉錄組分析 使用STAR進行比對
通過二代測序我們可以獲得150bp左右的reads，如果想要知道reads是從哪個轉錄本上測出來的，就需要將reads比對到參考基因組上。比對的演算法很複雜，但簡單理解就是看reads與基因組上哪個區域一致。wget c 解壓 star tar xvzf 2.7.3a.tar.gz 執行 star ...
轉錄組分析處理流程
1.fastqc 2.star build index star runthreadn 9 runmode genomegenerate genomedir data xx bio task le mir 03 2mirseq index genomefastafiles data xxbio ta...
轉錄組分析的正確姿勢
轉錄組分析是目前應用最廣的高通量測序分析技術之一。常見設計是不同樣品之間比較，尋找差異基因 標誌基因 協同變化基因 差異剪接和新轉錄本，並進行結果視覺化 功能注釋和網路分析等。轉錄組的測序分析也相對成熟，從rna提取 構建文庫 上機測序再到結果解析既可以自己完成，又可以在專業公司進行。概括來看轉錄組...