每到年終大家都愛做總結,除了我在每日文獻：2018-01-08提到的比對工具年鑑更新到了2017版,各大生物資料中心也開始紛紛做總結,然後發一篇核酸研究nar. 這三篇文章的標題和位址如下
地點資料庫名
原文標題
美國ncbi
database resources of the national center for biotechnology information
歐洲embl-ebi
the european bioinformatics institute in 2017: data coordination and integration
中國big
database resources of the big data center in 2018
資料庫之間每天都會互動資料,保證資料同步,並且都有自己的特色.
ncbi一覽
embl-ebi一覽
big一覽
如果ncbi訪問速度太慢, 我會去看一下embl-ebi,因為後者的網頁設計也非常的養眼. 但是big則是我最近從某一篇標題黨文章裡面了解的, 大致意思為big打破了資本主義的壟斷,取代了小日本的ddbj 躋身成為世界一流的資料中心.
bgi看來中國科學院的北京基因組組學中心的錢不太夠,還沒錢買硬碟放植物的資料.
每日文獻 2018 01 10
為了能夠適應環境，植物需要監控自身的代謝途徑，能夠符合當前的生長和防禦。初期代謝產物可以通過遍在保守tor target of rapamycin 通路進行衡量，在有限的能量和影響下平衡生長和發育之間的關係。最新的工作表明，植物能夠先估計防禦性代謝產物，制定好某些策略從而快速將資源重定位到植物生長和...
每日文獻 2018 01 29
這是一篇發表在 briefings in bioinformatics 的文章，這篇文章最大的亮點在於，作者只有乙個人，但是在摘要裡面，他可能害怕寂寞，於是在摘要裡我見到了 we,而不是i，或許他乙個人就是乙個團隊吧。這篇文章的工作等同把乙個公司的流程拿出來發，我們來比較一下公司的流程和他的流程 文...
每日文獻 2018 01 07
一圖了解常用測序及其適用範圍 所謂 遇事不決先測序，經費太多測個序 反應的就是當前測序的火熱程度。測序方法大多使用縮略語，比如說家耳熟能詳的rna seq，chip seq和最新火起來的atac seq。但是大家有沒有想過，當你們說rna seq時，未必指的是相同乙個生物學問題，有人可能是是定量，有...