由於最近不知不覺開始涉及群體遺傳學，所以準備精讀（其實就是原文翻譯）一篇review盡力去了解這個我陌生的領域。文章原標題為molecular signatures of natural selection， 作者rasmus nielsen。群體遺傳學數十年來一直被乙個問題所困擾，那就是如果在觀察物種中存在乙個遺傳變異，那麼應該如何定量得描述自然選擇對這個個變異形成的幫助。
即使有了大規模可用的基因組資料，這些問題依舊沒有得到解決，不過這些爭論已經把焦點從分子進化的一般定律或模式轉移到了特定的例子中，**自然選擇是如何塑造其變異模式。考慮到推測自然選擇在基因和基因組的模式和分布可以提供重要的功能資訊，這類工作做的人也越來越多。例如，在人類基因組中，和疾病相關的基因區域的分離應該低於選擇（假設疾病表型會導致適應性下降）。即便是非常小的適應性改變，從進化的時間尺度上也會造成非常大的改變。因此，從理論上來講找到人類基因組中那低於選擇的區域就能推測出和疾**子相關的區域。通常而言，基因組上低於選擇的區域往往有著非常重要的功能。這種基於選擇的推測也就廣泛用在識別功能域或氨基酸殘基。
每日文獻 2018 01 10
為了能夠適應環境，植物需要監控自身的代謝途徑，能夠符合當前的生長和防禦。初期代謝產物可以通過遍在保守tor target of rapamycin 通路進行衡量，在有限的能量和影響下平衡生長和發育之間的關係。最新的工作表明，植物能夠先估計防禦性代謝產物，制定好某些策略從而快速將資源重定位到植物生長和...
每日文獻 2018 01 12
每到年終大家都愛做總結,除了我在每日文獻 2018 01 08提到的比對工具年鑑更新到了2017版,各大生物資料中心也開始紛紛做總結,然後發一篇核酸研究nar.這三篇文章的標題和位址如下 地點資料庫名 原文標題 美國ncbi database resources of the national ce...
每日文獻 2018 01 29
這是一篇發表在 briefings in bioinformatics 的文章，這篇文章最大的亮點在於，作者只有乙個人，但是在摘要裡面，他可能害怕寂寞，於是在摘要裡我見到了 we,而不是i，或許他乙個人就是乙個團隊吧。這篇文章的工作等同把乙個公司的流程拿出來發，我們來比較一下公司的流程和他的流程 文...