把sra資料移動到我們工作目錄後，我們開始sra轉faq。
正式執行**之前，必須先拿乙個樣品測試下**能否執行成功，這點很關鍵，因為這步就算成功執行也特別慢，要是**再出錯了就更浪費時間了。
ls srr5315196.sra |fastq-dump -gzip --split-3 -o ./ srr5315196.srasra-tools 裡的 fastq-dump工具可以將srr檔案轉換為fastq格式，–split-3引數表示如果是雙端測序就自動拆分，如果是單端不受影響。也就是說，–split-3引數可以將pe的sra檔案解壓後的fastq檔案拆分成_1.fastq和_2.fastq，如果示例資料集是se測序，不會進行拆分。–gzip轉換fastq為壓縮檔案，節省空間。
單個測試成功，那我們就寫迴圈進行批量轉換格式。
cat >sra.sh #寫指令碼 ls srr* |while read id; do (fastq-dump -gzipd表示–split-3 -o ./ id)
1>./
) 1>./
id)1
>./
.sra.log 2>&1;done #多個迴圈 nohup bash sra.sh & #掛後台執行
輸出（o
utpu
t）到當
前資料夾
下，檔案
名字首不
變（這樣
的話輸出
張這樣s
rr5315196.fa
stq.
gz）1
>./
表示輸出（output）到當前資料夾下，檔名字首不變（這樣的話輸出張這樣srr5315196.fastq.gz） 1>./
id表示輸出
（out
put）
到當前文
件夾下，
檔名字首不變（
這樣的話
輸出張這
樣srr
5315
196.
fast
q.gz
）1>./
.sra.log 2>&1 （0.標準輸入；1.標準輸出；2.標準錯誤）這個命令是說，重定向標準輸出到當前檔案下srr5315197.sra.sra.log檔案，且標準輸出、標準錯誤到乙個檔案中（2>&1）
製作config檔案
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