返回值:gds/gse/gsm/gpl。取決於geo引數。
getgeo(geo = null, filename = null, destdir = tempdir(),
gselimits = null, gsematrix = true, annotgpl = false, getgpl = true,
parsecharacteristics = true)引數
注釋geo
filename
destir
gsematrix
getgpl
getgeosuppfiles(geo, makedirectory = true, basedir = getwd())
返回值:supplementary data。
引數注釋
geomakedirectory
basedir
功能:解壓縮gz格式的檔案。
返回值:從gz壓縮檔案中提取的檔案。
gunzip(filename, destname = gsub("[.]gz$", "", filename), overwrite = false,
remove = true, bfr.size = 1e+07)引數
注釋filename
需要解壓縮的檔名,可以為list。
destname
解壓縮之後的檔名。預設去除.gz$
overwrite
是否覆蓋重名檔案。預設為false
remove
解壓完是否刪除原檔案。預設為true。
citation("geoquery")
引用geoquery genefilter包常用函式
功能 只留下檢驗統計量最大的探針,捨棄其他重複探針。返回值 包含探針名稱的list。findlargest gn,teststat,data hgu133plus2 引數 注釋gn 包含所有探針名稱的list。teststat 包含檢驗檢測統計量的list,長度和gn一致。data 晶元標識。功能 ...
oligo包常用函式
功能 提供顏色。返回值 表示顏色的字元。darkcolors n seqcolors n seqcolors2 n divcolors n 注意 darkcolors是基於rcolorbrewer包設計的。功能 對featureset擬合robust probe level linear model...
Python強大的pandas包常用函式
import pandas as pd filepath01 r f data temp gd net loss data demo01.csv data01 pd.read csv filepath01 print data01.head 5 print data01.columns 返回全部列名...