對比mysql, mongo的優缺點有：
缺點l 不支援事務操作
l 占用空間過大
l mongodb沒有如mysql那樣成熟的維護工具
l 無法進行關聯表查詢，不適用於關係多的資料
l 複雜聚合操作通過mapreduce建立，速度慢
| 模式自由，自由靈活的檔案儲存格式帶來的資料錯誤
|預分配模式帶來的磁碟瓶頸。
mongodb採用資料檔案預分配模式來生成資料檔案，資料檔案的大小從64m開始，每增加乙個檔案，大小翻倍，直到2g，以後每次增加資料就會生成2g左右的資料檔案，結合mongodb的mmap記憶體模型，對於寫資料檔案，將隨機寫轉換為順序寫，一定程度上緩解了磁碟的io壓力。
但在實際使用中，遇到了在預分配2g的資料檔案時，如果磁碟io較慢，則mongodb基本鎖死，無法響應請求的情況。持續時間則根據磁碟io的效能來確定。這個問題在2.0之後版本可能會有些改善，但在磁碟效能低的伺服器上，該問題依舊存在.
這個問題目前沒有太好的解決方案，只能建議使用讀寫效能比較好的伺服器來跑mongodb。
在資料存量大於記憶體大小時，mongodb遇到冷資料查詢速度變慢。
mongodb使用mmap的記憶體管理模式，如果查詢的都是熱資料，那麼會在記憶體中直接查詢，如果遇到冷資料，就需要從磁碟讀取，並將一部分熱資料從記憶體解除安裝掉.
有人曾經說mongodb記憶體管理是載入固定大小的檔案塊到記憶體，即如果冷資料在磁碟上，他會根據請求的資料，載入一定大小的資料塊到記憶體，並解除安裝掉同樣的熱資料，這個操作本身會帶來一定io.
因為mongodb使用的是全域性鎖，在某個操作緩慢時，整個操作佇列會全部變慢。這個問題造成了mongodb會出現偶發性堵塞問題，連帶整個庫的效能下降。
該問題在應用需要盡量避免出現，需要將mongodb的資料大小規劃好，盡量不要使資料量超過記憶體的大小，如果超過記憶體大小後，盡量不要去請求冷資料。
mongodb全域性鎖機制。
mongodb最大的問題或者可以說是它的鎖機制，在2.2版本之前，乙個例項只有乙個讀寫鎖，不管有多少資料庫和資料集合，當乙個操作進行時其他操作只能等待，在2.2版本後，mongodb鎖降低了粒度，改為按庫鎖。
mongodb 使用的是「readers-writer」鎖， 可以支援併發但有很大的侷限性，當乙個讀鎖存在,許多讀操作可以使用這把鎖，然而, 當乙個寫鎖的存在，乙個單一的寫操作會exclusively 持有該鎖，同時其它讀，寫操作不能使用共享這個鎖；舉個例子，假設乙個集合裡有 10 個文件，多個 update 操作不能併發在這個集合上，即使是更新不同的文件。
刪除資料集合後空間不會自動釋放
mongodb刪除集合後磁碟空間不釋放，只有用db.repairdatabase()去修復才能釋放。
修復可能要花費很長的時間,在使用db.repairdatabase()去修復時一定要停掉讀寫，並且mongodb要有備機才可以，不然千萬不要隨便使用db.repairdatabase()來修復資料庫，切記。
但是在修復的過程中如果出現了非正常的mongodb的掛掉，再次啟動時啟動不了的，需要先修復才可以，可以利用./mongod --repair --dbpath=/data/mongo/ 如果你是把資料庫單獨的放在乙個資料夾中指定dbpath時就指向要修復的資料庫就可以。
7. replica set一些隱含問題
a) replica set模式最多支援12臺伺服器，而有投票權的伺服器只支援7臺，如果超過7臺伺服器，需設定部分伺服器為無投票權伺服器
b) replica set模式中，乙個set伺服器如果小於2臺伺服器，則自動故障恢復不會起作用，如果4臺伺服器出現2/2互相ping不通的情況，同樣不會自動故障恢復。一般來說，乙個set中盡量是有單數伺服器。
c). replica set中，因為mongodb是按照時間進行操作，如果set中某個伺服器時間超前或者延遲，很容易出現secondaries不斷嘗試更新oplog或者同步延遲的問題。甚至造成某些操作失敗，如drop操作。
8. 分片模式的一些隱含問題
1. config server盡量按照官方的要求，有3個configserver，如果只有2個configserver，則shard的自動負載均衡和自動切片功能不可用。
2. api中的nearest模式在shard中，判斷的是set到mongos的距離而非set到client的距離，在切片模式下，盡量不要使用nearest模式，可能會造成一些請求延遲增加的問題。
優點l 文件結構的儲存方式，能夠更便捷的獲取資料
l 內建gridfs，支援大容量的儲存
l 內建sharding，分片簡單
l 海量資料下，效能優越
l 支援自動故障恢復（複製集）
mongodb是乙個介於nosql資料庫和mysql資料庫之間的乙個資料儲存系統，它沒有嚴格的資料格式，但同時支援複雜查詢，而且自帶sharding模式和replica set模式，支援分片模式，複製模式，自動故障處理，自動故障轉移，自動擴容，全內容索引，動態查詢等功能。擴充套件性和功能都比較強大。
mongodb在資料查詢方面，支援類sql查詢，可以乙個key多value內容，可以組合多個value內容來查詢，支援索引，支援聯合索引，支援複雜查詢 ，支援排序，基本上除了join和事務型別的操作外，mongodb支援所有mysql支援的查詢，甚至某個客戶端api支援直接使用sql語句查詢mongodb。
mongodb的sharding功能目前日漸完善，支援自定義範圍分片，hash自動分片等，分片自動擴容，shard之間自動負載均衡等功能。實際使用中功能還不錯。
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