產生的一系列檔案中:
(1)頭動矯正 其中fd_jenkinson最好
下面這個是很早以前用來排除被試的,現在不用了,現在都用meanfd排除
headmotion.tsv: 顯示最大或平均頭動,mean fd,...一般使用 mean fd後面做統計分析
(2)reonent fun和reonent t1用於質量控制,調整位置到前聯合(空間的原點) 自己可以打分
有的被試被掃的面積沒有覆蓋到全腦,用來檢驗蓋住的多少,
(4)t1 dicom to nifti:
dicom的結構像轉成nifti
(5)bet: 結構像和功能像配準之前去除頭皮干擾
具體步驟:先bet去除頭皮干擾,然後結構像去配準功能像,後再應用到之前未去頭皮的結構像,再去segment分割(帶著頭皮分割效果好,bet也有可能損傷)
(6)t1 coreg fun:結構像配到功能像空間
(7)segment:把大腦的結構像分割成灰質、白質和腦脊液,是老的segment不用
用new segment+dartel: 36min
segment生成的結果:
(8)nuisance covariates regression:去除雜訊
polynomial trend:1 去除線性漂移
head motion model: 用friston 24 做頭動矯正
(9)normalize 空間配準
意義:將很多被試者的大腦配到乙個標準的模板上面,才能對相同的東西進行比較,如pcc
方法:1.epi模板 2.t1先對t1分割成白質灰質腦脊液,再用到功能影象上去 3.dartel:用的最多
45min dartel:基於分割結果,基於100個被試的group ,,再把這個模板配到mni空間 費時。。
smooth:提高配準效果 注:計算reho、degree前不要用smooth!
default mask:基於腦內的體素進行
至此,所有的預處理步驟選擇完畢!!! (只進行預處理的話,下面所有的一切全都不用選了)
資料分析:
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