1 cutadapt -a agatcggaagagcacacgtct -m 15 -q 20 --discard-untrimmed -o outname .fa
--discard-untrimmed 把reads中不含有adaper的reads去掉
-a剪下reads 3'端adapter(雙端測序第一條read)，加$表示adapter錨定在reads3'端可找公司要
-g剪下reads 5'端adapter(雙端測序第一條read)，加$表示adapter錨定在reads 5'端
-q 低質量鹼基
-m readsd短於15時，丟棄該reads
我做的是植物。選擇的mirna長度為 15-30 bp
可自行寫指令碼進行統計
用r進行作圖，ggplot
在24 中有乙個峰值
MySQL WHERE資料過濾（一）
在select語句中，可以對資料根據where子句指定的搜尋條件進行過濾。where子句在表名 from子句 之後給出，其格式如下所示 select 列名 from 表名 where 搜尋條件 where子句位置 where子句應位於表名 from子句 之後。在同時使用order by子句時，ord...
WinPcap程式設計 6 過濾 分析資料報
winpcap和libpcap的最強大的特性之一，是擁有過濾資料報的引擎。它提供了有效的方法去獲取網路中的某些資料報，這也是winpcap捕獲機制中的乙個組成部分。用來過濾資料報的函式是 pcap compile 和 pcap setfilter pcap compile 它將乙個高層的布林過濾表示...
資料報過濾及分析例項 tshark tcpdump
平時需要對資料報進行分析和統計，儘管使用python scapy庫來開發很方便，但若是熟悉tshark wireshark的命令列 tcpdump 等工具，含editcap，mergecap 等，寫個簡單的shell分析指令碼，那會更加方便 tcpdump tshark 過濾出 src.pcap 中...