2021最新常用腫瘤生信資料庫收藏級彙總!

2021-10-18 18:44:14 字數 885 閱讀 7167

資料庫分類

綜合性腫瘤資料庫

基因組資料庫

遺傳變異資料庫

dna甲基化資料庫

具體癌種或疾病資料庫

資料庫列表

01

綜合性腫瘤資料庫

tcga(the cancer genome atlas):

tcga(the cancer genome atlas,癌症基因**譜)由 national cancer institute(nci,美國國家癌症研究所) 和 national human genome research institute(nhgri,美國國家人類基因組研究所)於 2006 年聯合啟動的專案, tcga對超過20,000例原發性癌症進行了分子特徵分析,並同時儲存了33種癌型配對的正常樣本。

icgc:(international cancer genome consortium):

icgc全稱是international cancer genome consortium。icgc資料報括50種不同癌症型別/亞型的腫瘤中的基因組異常(體細胞突變,基因異常表達,表觀遺傳修飾)資料,也包括tcga中的資料。

cosmic

cosmic收錄在癌症中體細胞突變的資料,是世界上最大和最全面的癌症突變資源,用於探索人類癌症中體細胞突變的影響。它主要提供腫瘤細胞基因組中的cna、甲基化、基因融合、snp及基因表達等資料。

生信學習 TGCA資料庫的命名原則

在tgca資料庫中乙個患者至多對應兩個樣本,但在原始選區的時候,一共是有多個樣本可以選取的,從這多個樣本中選取陰性 癌旁組織 和陽性 癌組織 最好的那個,當然,如果只有陽性或陰性的話,那麼至多只有1個樣本。如 tgca a6 6650 01a 11r 1174 07 tgca a6 6650 01a...

Mysql資料庫操作常用命令(最新)

1.mysql中常用命令 1 可以在cmd中輸入mysql uroot p123456 2 顯示表結構 describe 表明 或者 desc 表明 3 檢視 mysql 中有哪些個資料庫 show databases 4 使用乙個資料庫 use 資料庫名稱 5 新建乙個資料庫 create dat...

常用資料庫

全名 microsoft office access access 是微軟公司推出的基於windows的桌面關聯式資料庫管理系統 rdbms,即relational database management system 是office系列應用軟體之一。它提供了表 查詢 窗體 報表 頁 巨集 模組7種...