在做相關性分析的過程中提示,不相容的量度主要是維度上有問題,在做相關性分析的時候要保持兩個矩陣或者資料框的行數一致,這是前提,在比較之前檢查一下,行列數目顛倒時,利用轉置函式t轉置一下就可以了具體提示資訊:
error in cor(tp53_expr, ratio_cells, method = 「pearson」) : 不相容的量度
> mat1<-matrix(seq(1:10))
> mat2<-matrix(seq(1:20),ncol = 2)
> mat2
[,1]
[,2]
[1,] 1 11
[2,] 2 12
[3,] 3 13
[4,] 4 14
[5,] 5 15
[6,] 6 16
[7,] 7 17
[8,] 8 18
[9,] 9 19
[10,] 10 20
> cor(mat1,mat2,method =
"pearson"
)[,1]
[,2]
[1,] 1 1
> cor(t(mat1),mat2,method=
"pearson"
)error in cor(t(mat1), mat2, method =
"pearson"
): 不相容的量度
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