Anaconda安裝及使用

2021-10-05 14:39:09 字數 1737 閱讀 8057

wget
2.安裝

bash anaconda3-5.3.1-linux-x86_64.sh
3.接下來會出現一些讓你進行操作的問題(閱讀協議書),直接按enter即可。

這個是會問你是否接受協議,輸入yes。

4.如果想要更改安裝路徑,如下圖。因為後續出現了一些問題,又重新安裝回了預設路徑home下。

5.會問你要不要自動配置環境變數,如果是新手我的建議是yes。因為選擇no,就需要自己去配置,容易出錯。配置的話就是編輯變數檔案(~/.bashrc),將對應的安裝路徑輸入(我的作為參考例子),然後儲存退出,source ~/.bashrc 即可。

6.是否安裝vscode?看個人需求,我選擇了no.

至此,安裝完畢,重新進入伺服器後輸入conda命令

7.安裝軟體

一般敲如下**即可安裝

conda install package_name
但有時會遇到在當前的channels中找不到需要的包。可以使用下面的命令來查詢想要安裝的包,以bx-python為例。

anaconda search -t conda bx-python
終端會顯示很多包以及對應的版本,適用平台。這時候根據自己的需求挑選。

比如在這裡我選擇 bioconda/bx-python。使用show指令來檢視該包的詳細情況

anaconda show bioconda/bx-python
會反饋該包的版本和安裝指令,如果需要安裝就複製最底下的**。

最後也可以通過conda list來檢查已經安裝的所有包和版本。

8.解除安裝

直接刪除anaconda資料夾:

rm -rf ~/anaconda3

再檢查環境變數檔案,刪除對應的行即可。

ps:太忙了好久沒更新,寫完才發現這次的排版太糟糕了,下次有時間再修改吧。

安裝conda的主要原因是因為在安裝hic-pro時發現很多依賴包還是用conda安裝更省時省力,環境也乾淨。

安裝hic-pro時也看了很多帖子,遇到了很多問題,所以下一次寫一下這個軟體的安裝使用和我遇到的問題。

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