雷鋒網按:開發新藥是是一項漫長而且低效率的工作。資料顯示,所有進入臨床試驗階段的藥物,只有不到12%的藥品最終能夠上市銷售,而且一款新藥的平均研發成本高達26億美金。
藥物研發人員需要對各種不同的化合物以及化學物質進行測試,這個試驗過程中的錯誤嘗試耗費了太多的時間和金錢。由於需要測試的分子太多,研發人員不得不使用移液機械人一次測試幾千種變體,然後選擇最有效的變體進行動物模型或者細胞培養試驗,希望其中一些最終能夠進入人類臨床試驗階段。
由於不斷試錯的成本太高,越來越多的藥物開發廠商開始轉向計算機和人工智慧,希望利用這種技術來縮小潛在藥物分子的範圍,從而節省後續測試的時間和金錢。為了識別那些有很大潛力可以作為藥物靶標的蛋白質的編碼基因,這些廠商把希望寄託了演算法上。目前,一些新的演算法模型(包括近日發布在《science translational medicine》上)增加了新層次的複雜性,用來縮小相關蛋白質、藥物和臨床資料的範圍,以便更好地**哪些基因最有可能讓蛋白質和藥物結合。
「許多原因都可能導致藥物研發失敗。」遺傳流行病學家aroon hingorani說,「然而,其中乙個主要的原因是沒能針對疾病選擇正確的靶標。」一種藥物可能在細胞、組織、以及動物模型的早期實驗中顯示初步的前景,但是這些早期實驗往往過於簡單,很少使用到隨機盲法實驗進行對照。科學家們會使用這些結果來**哪些蛋白質可以作為藥物標靶,但是由於這些研究往往規模很小而且時間較短,因此有很多因素會造成誤判。
然而,hororani的小組並沒有依賴這些有侷限性的試驗,他們建立了乙個將基因資訊、蛋白質資料結構和已知藥物的作用過程相結合的**模型。最終,他們獲得了將近4500種潛在藥物靶標,相比之前**的可成藥人類基因組數量,翻了一倍。然後,兩名臨床醫生梳理出了具有正確形狀和化學物質的144種藥物,除了那些已經發現的可與之相結合的標靶蛋白外,這些藥物還可以與其他的蛋白質結合。由於這些藥物此前已經通過了安全測試,這意味它們可以很快被用於**其他疾病。對於藥物開發商來說,時間就是金錢。
研究人員估計,大約15%~20%的新藥成本都耗費在探索階段。通常情況下,這意味著高達幾億美元的支出,以及3~6年的工作。如今,有人希望通過ai將這一過程縮短至幾個月,並大幅降低研發成本。不過,目前市場上還沒有一款藥物是ai系統一開始挑選出來的,但是他們正在走上正軌。
hingorani的合作者之一是benevolentai生物醫學資訊學副總裁。benevolentai是一家英國ai公司,最近剛剛與janssen(強生旗下子公司)簽署了一項收購和開發臨床試驗候選藥物的協議。他們計畫在今年晚些時候開始iib階段的試驗。(iia階段會先入組少量受試者,確立合適的**劑量;iib則是在a的基礎上有效組擴大樣本量,明確劑量等有效性、安全性。)
但是,長期從事藥物開發研究的derek loewe在《science》的個人部落格上撰文稱,他對於這種純粹的計算方法持懷疑態度。「從長遠來看,我並不覺得這個東西是不可能的。」他說,「但是如果有人告訴我,他們能**所有這麼多化合物的活動,那麼我可能會認為這是在胡說八道。在相信之前,我想看到更多證據。」
像twoxar這樣的公司就正在努力建立起這樣的證據。去年秋天,他們與史丹福大學的asian liver center(亞洲肝病中心)合作,為成年肝癌患者篩選了25000種候選藥物。他們利用自己開發的計算機軟體,結合遺傳、蛋白質組學、藥物和臨床資料篩選了出了10種可能的藥物。
asian liver center的主任samuel so對結果非常驚訝,因為其中幾種利用計算機軟體篩選出的藥物和實驗室研究人員的**相同,所以他決定測試所有的10種候選藥物。其中最有希望的一種藥物,能夠殺死5種不同的肝癌細胞,並且沒有傷害到健康細胞,現在正準備進行人體試驗。目前,唯一一款針對同一癌症的藥物花費了5年時間才獲得了fda(美國食品藥品監督管理局)的批准,而twoxar和斯坦福到現在為止才用了4個月。
令人興奮的是:對於失敗率如此高的行業,即使是很小的進步,也可能撬動數十億美元的市場,更不用說那些那些可能因此被拯救的生命。但是,除非通過ai系統發現的藥物真正上市銷售,否則這個行業的研發模式不會發生根本性的變革。
via. wired,雷鋒網編譯
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