從概率的角度來看，每個read的比對都是乙個真實比對的估計，它是乙個隨機變數，也有可能存在錯誤。錯誤的概率可以用 phred 來衡量。假設一條read的mapq的值為 $mq, $p 表示reads比對錯誤的概率。
$p = 10 ^ (-$mq / 10.0);值為30，
那麼
mq的值為30，那麼
mq的值為3
0，那麼
p(比對錯誤率） 就是 0.1%。
read 中鹼基質量值，低質量值的鹼基意味著序列很可能是錯誤的，錯誤的序列可能會導致錯誤的比對，所以mapq會低；
比對演算法的敏感性，如果比對演算法敏感性差，會造成比對錯誤，mapq低；
單雙端測序的影響，如果reads兩端都可以比對到基因組同一位置，那麼比對正確的可能性很大，mapq會高；
如果mapq在30以上，一般是：
a. read 的全部鹼基質量值很高；
b. 比對幾乎沒有mismatch，1-2bp的mismatch有可能是真是存在的變異；
這個嘛，我還沒有來得及看，先留個坑後面填。。。
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