結合血管資訊的視盤定位

結合血管資訊的視盤定位

%% matched filter2，測試程式

clc,close all,clear all;
%% 讀取影象
img=imread('e:\糖網\預處理\shipantiqu\shipan4\roi4.jpg');
%% 轉換成灰度影象
if length(size(img))==3
img0=rgb2gray(img);
end%% 自適應直方圖均衡化
img1 = adapthisteq(img0, 'numtiles', [15 15], 'cliplimit', 0.05);
figure,imshow(img1);
%% 高斯匹配濾波
[g,bg]=matchedfilter2(img1);
figure,imshow(bg);
%% 腐蝕處理
he = strel('disk',2);
img2=imerode(bg,he);
figure;imshow(img2);
%% 提取連通域
img3=xueguanliantongyu(img2);
figure,imshow(img3);
%% 形態學膨脹得到較為完整的包含滲出物的候選區域
he = strel('disk',1);
img3=imdilate(img3,he);
figure,imshow(img3);
img0=double(img0);
img4=img0.*img3;
% img0=double(img0);
% img4=img0.*(1-img3);
% figure,imshow(uint8(img4));
% % img5=imreconstruct(img4,img0);
% figure,imshow(uint8(img5));
% % img6=img0-img5;
% figure,imshow(img6);
%% 視盤定位
n1=[135  120  120  105  90  75  60  60  45;
150  135  120  105  90  75  60  45  30;
150  135  135  120  90  60  45  30  30;
165  165  150  135  90  45  30  15  15;
0  0  0  0  0  0  0  0  0;
15  15  30  45  90  135  150  165  165;
30  30  45  60  90  120  135  150  150;
30  45  60  75  90  105  120  135  150;
45  60  60  75  90  105  120  120  135];
n2=[2 2 2 2 2 2 2 2 2;
2 2 2 2 2 2 2 2 2;
2 2 3 3 3 3 3 2 2;
2 2 3 3 3 3 3 2 2;
2 2 3 3 3 3 3 2 2;
2 2 3 3 3 3 3 2 2;
2 2 3 3 3 3 3 2 2;
2 2 2 2 2 2 2 2 2;
2 2 2 2 2 2 2 2 2];
n3=n1.*n2;
y=imfilter(img4,n3,'replicate');
figure,
subplot(121),imshow(y);
[n]=max(max(y));
[p q]=find(n==y);
m=y>=n;
% imwrite(m,'e:\糖網\預處理\shipantiqu\shipan6\xiangying6.jpg')
subplot(1,2,2),imshow(m);
hold on;
plot(q, p, 'g*');

function [g,bg]=matchedfilter2(f)

f=double(f);
% subplot(1,2,1);
% imshow(uint8(f));
% title('origin image');
% mean filter
f=medfilt2(f,[5,5]);
% f=medfilt2(f,[21 1]);
% f=medfilt2(f,[1,7]);
% 引數
os=12;  % 角度的個數
sigma=2;
tim=3;
l=9;
t=120; % 全域性閾值,需要多次嘗試
thetas=0:(os-1);
thetas=thetas.*(180/os);
n1=-tim*sigma:tim*sigma;
n1=-exp(-(n1.^2)/(2*sigma*sigma));
n=repmat(n1,[2*floor(l/2)+1,1]);
r2=floor(l/2);
c2=floor(tim*sigma);
[m,n]=size(f);
rns=cell(1,os);  % rotated kernals 旋轉角尺
mfrs=cell(1,os); % filtered images 
g1=f;
% matched filter
for i=1:os
theta=thetas(i);
rn=imrotate(n,theta);
%去掉多餘的0行和零列
rn=rn(:,any(rn));
rn=rn(any(rn'),:);
meann=mean2(rn);
rn=rn-meann;
rns=rn;
mfrs=imfilter(f,rn,'conv','symmetric');
end 
% get the max response
g=mfrs;
for j=2:os
g=max(g,mfrs);
endbg=g>t;
% subplot(1,2,2);
% imshow(bg);
% title('filterd image');
end

function [img]=xueguanliantongyu(i)

if length(size(i))>2
i = rgb2gray(i);
endif ~islogical(i)
imbw = im2bw(i);                        %轉換為二值化影象
else
imbw = i;
endimbw = im2bw(i);                        %轉換為二值化影象
imlabel = bwlabel(imbw);                %對各連通域進行標記
stats = regionprops(imlabel,'area');    %求各連通域的大小
area = cat(1,stats.area);
index = find((area >=1000)&(area<=10000000));        %求最大連通域的索引
img = ismember(imlabel,index);          %獲取最大連通域影象

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