用R軟體處理TCGA資料可能出現的錯誤

2021-09-02 01:32:16 字數 323 閱讀 2295

r軟體報錯:無法分配大小為2.4 gb的向量。

解決方法:通過ls()看work space中有什麼變數;

通過object.size()看每個變數占多大記憶體;

通過memory.size()檢視現在的work space的記憶體使用;

通過memory.limit()檢視系統規定的記憶體使用上限;

通過memory.limit(newlimit)更改到乙個新的上限;

可以使用rm(object)刪除變數,然後使用gc()做garbage collection來釋放記憶體。

通常是因為路徑中含有中文名字導致的,換成英文就可以正常執行了

用R處理不平衡的資料

在分類問題當中,資料不平衡是指樣本中某一類的樣本數遠大於其他的類別樣本數。相比於多分類問題,樣本不平衡的問題在二分類問題中的出現頻率更高。舉例來說,在銀行或者金融的資料中,絕大多數信用卡的狀態是正常的,只有少數的信用卡存在盜刷等異常現象。使用演算法不能獲得非平衡資料集中足以對少數類別做出準確 所需的...

用R處理不平衡的資料

雲 社群翻譯社,作者 arrayzoneyour 在分類問題當中,資料不平衡是指樣本中某一類的樣本數遠大於其他的類別樣本數。相比於多分類問題,樣本不平衡的問題在二分類問題中的出現頻率更高。舉例來說,在銀行或者金融的資料中,絕大多數信用卡的狀態是正常的,只有少數的信用卡存在盜刷等異常現象。使用演算法不...

R軟體處理資料集中的缺失值

現實中的資料集經常會遇到缺失值的情況,在模型分析之前往往需要對其進行適當的處理,其方法無外乎刪除與填補。但無論是刪除還是填補,均應該先檢視缺失值情況,以algae資料集為例 ld algae complete.cases algae 取數的思路就是先定位到缺失值,再提取出來,記住r中所有操作皆是函式...