(2)安裝：
2、修改lordec的makefile，定義gatb-core-1.3.0路徑，
3，make
（2）使用
1. 校正pacbio reads
lordec-correct -k 19 -s 3 -a 5 -2 ngs.fq -i iso.fa -t 4 -s statistics.txt -m 20g -o correcthq.fa
k-mer（-k）：小基因組設定為19； 大基因組設定為21；豐度閾值（-s）設定為2或3
2. 統計
lordec-stat -t 2 -a 5 -i iso.fa -2 ngs.fq -k 19 -s 3 -s lordec_stat.txt
3. trim校正後的pacbio序列
lordec-trim -i correcthq.fa -o lordec_trimmed_reads.fa
4. trim和分割校正後的pacbio序列
lordec-trim -i correcthq.fa -o lordec_trimmed_reads.fa
5. 建立和儲存二代資料的dbg
在Centos中yum安裝和解除安裝軟體的使用方法
在centos中yum安裝和解除安裝軟體的使用方法 安裝方法 安裝乙個軟體時 安裝多個相類似的軟體時 安裝多個非類似軟體時 解除安裝乙個軟體時 解除安裝多個相類似的軟體時 解除安裝多個非類似軟體時 另外還有乙個非常棒的用法 假如我要執行iostat這個命令來檢視cpu與儲存裝置狀態，可是執行卻發現沒...
在Centos中yum安裝和解除安裝軟體的使用方法
在centos中yum安裝和解除安裝軟體的使用方法 安裝方法 安裝乙個軟體時 安裝多個相類似的軟體時 安裝多個非類似軟體時 解除安裝乙個軟體時 解除安裝多個相類似的軟體時 解除安裝多個非類似軟體時 另外還有乙個非常棒的用法 假如我要執行iostat這個命令來檢視cpu與儲存裝置狀態，可是執行卻發現沒...
在Centos中yum安裝和解除安裝軟體的使用方法
安裝乙個軟體時 安裝多個相類似的軟體時 安裝多個非類似軟體時 解除安裝乙個軟體時 解除安裝多個相類似的軟體 解除安裝多個非類似軟體時 別的還有乙個非常棒的用法 假如我要執行iostat這個命令來檢視cpu與 儲存裝置狀態,可是執行卻發現沒有這個命令 於是執行yum install iostat,結果...