根據id提取fasta序列

bioperl讀入寫出fasta

要求根據序列id，從fasta檔案中提取目標序列並輸出

資料序列id

fasta檔案

思路以序列id為鍵，構建雜湊

用bioperl讀入fasta，獲得序列id

如果id存在於雜湊中，輸出序列

**

die "perl $0 " unless(@ar**==3);

#$0程式名
use bio::seqio;
use bio::seq;
$in = bio::seqio->new(-file=>"$ar**[1]", -format =>'fasta');
$out = bio::seqio->new(-file=>"$ar**[2]", -format=>'fasta');
my %keep=();
open (in, "$ar**[0]") or die "$!";
while()=1;
}close in;
while(my$seqobj = $in->next_seq()))	
}$in->close();
$out->close();

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