conda 是乙個開源的軟體包管理系統和環境管理系統，用於安裝多個版本的軟體包及其依賴關係，並在它們之間輕鬆切換。
.0-linux-x86_64.sh建議使用清華源
conda config --add channels
.tsinghua
.edu
.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels
.tsinghua
.edu
.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels
.tsinghua
.edu
.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels conda-forge
conda config --add channels r
conda config --add channels bioconda
conda config --add channels defaults
conda config --set show_channel_urls yes
#配置檔案在 ~/.condarc
channels:
-.tsinghua.edu.cn/anaconda
/pkgs/free
/ -
/cloud/bioconda
/conda
-conda-forge
-r-bioconda
-defaults
show_channel_urls yes
ssl_verify: true
#安裝r核心
conda install -c r r-essentials
conda info -e #檢視所有環境
conda info #當前環境
#建立虛擬環境 py35
conda create -n py35 python=3.5
source activate py35 #進入 py35 這個虛擬環境
source deactivate #退出
conda remove -n env_name --all #移除虛擬環境
conda list #列舉當前活躍環境下的所有包
conda list -n your_env_name #列舉乙個非當前活躍環境下的所有包
conda install numpy pandas #安裝
conda install -n env_name pandas
conda uninstall pandas #刪除
conda search pyqtgraph #查詢包
conda update numpy #更新包
conda remove numpy #解除安裝包
conda install 軟體名=版本號 #安裝指定版本
conda 安裝指定路徑 HiCPro安裝與使用
hic pro可以用來處理hi c資料，從原始的fastq檔案 illumina資料 到標準化的互動圖譜。簡單的來說就是將hi c資料比對到拼裝好的參考基因組上，並形成互動檔案去儲存hi c資料。下面我們就來介紹一下hic pro的安裝與使用。python版本為2.7 conda create n ...
conda的安裝與操作備忘
2.安裝miniconda conda的使用 conda miniconda和anaconda conda是一種通用包管理系統，旨在構建和管理任何語言和任何型別的軟體。舉個例子 包管理與pip的使用類似，環境管理則允許使用者方便地安裝不同版本的python並可以快速切換。anaconda則是乙個打包...
如何安裝並使用conda指令管理python環境
一 動機 最近打算折騰vn.py，但只有py27版本的，因為一向習慣使用最新穩定版的，所以不得不裝py27的環境，不得不說 python的全域性鎖真的很煩。身為懶癌患者，必然使用全功能的anaconda，但不想同時裝py27和py35兩個版本的anaconda巨無霸 同時裝兩個，不知道conda是否...