DBSCAN基於密度的聚類演算法

2021-07-31 17:07:30 字數 2524 閱讀 2141

1.密度:密度指的是在某距離內含有物件的最小數目。

2.核心物件:如果乙個物件的eps鄰域內至少包含minpt個物件,則稱該物件是核心物件。

3.直接密度可達:給定乙個物件集合d,如果p在q的eps鄰域內,並且q是乙個核心物件,則p是從q直接密度可達的。(如下圖所示),eps可以想象為乙個超球體的半徑,minp就是這個超球體內的點,這樣比較容易理解。

4.密度可達:對於q和p之間,有乙個樣本序列p1,p2,p3,……,pn, 其中p1=q, pn=p,若pi+1是由pi直接密度可達的(關於eps和minpts),則物件p是由q關於eps和minpts密度可達的。(如下圖所示)

在dbscan演算法中,乙個簇就是從乙個點出發,所有密度可達的點的集合,如果某乙個點不屬於任何乙個簇,也就是說這個點不能由任何點密度可達,那麼這個點被稱為異常點。

演算法流程:

1、輸入:樣本d=,鄰域引數(eps,minpts),距離的度量方式(本文中我們用歐幾里得距離來介紹,事實上大部分時候也用的是歐幾里得距離方法)

2、輸出:簇劃分、異常點索引

演算法實現:

1、初始化聚類的簇數k=0,已訪問樣本物件vt為空,分類結果result為空,異常索引noise為空。

2、遍歷m的樣本物件,判斷其是否為核心物件,若不是核心物件,在索引對應的vt中標記為1,表示該物件已訪問。如果是核心物件,則聚類簇數k=k+1,並且找到它的領域內的所有物件,標記已訪問,遍歷每乙個鄰域中的點,且在result矩陣中,所有密度可達的物件對應的索引位置都賦予k值。

3、對result矩陣取反,就是noise矩陣。也就是說result矩陣中,值為0的位置說明對應的樣本不屬於任何簇,是異常的。

總之,說的有點簡單,具體見原始碼如下。

function [result, noncore,noise] = dbscan

(setofpoints, eps, minpts)

cluster = 0;

sizeofcell = size(setofpoints,1);

result = zeros(sizeofcell,1);

%歐氏距離矩陣dmatrix,對應於各個樣本點之間的距離。

dmatrix = pdist2(setofpoints,setofpoints);

%初始化已訪問樣本和雜訊樣本。

visited = false(sizeofcell,1);

noncore = false(sizeofcell,1);

forindex = 1 : sizeofcell

if visited(index) == false

visited(index) = true;%已訪問標記。

neighbors = regionquery(index, eps);

if numel(neighbors) < minpts

noncore(index) = true;

else

cluster = cluster + 1;

expandcluster(index, neighbors, cluster, eps, minpts)%找出所有密度可達的點,歸於cluster類。

endendend

function

expandcluster

(index, neighbors, cluster, eps, minpts)

result

(index) = cluster;

temp = 1;

while

true

neighbor = neighbors(temp);

if visited(neighbor) == false

visited(neighbor) = true;

neighborssecond = regionquery(neighbor, eps);

if numel(neighborssecond) >= minpts

neighbors = [neighbors neighborssecond]; %密度可達點的索引擴充套件

endendif

result(neighbor) == 0

result(neighbor) = cluster;

endtemp = temp + 1;

if temp > numel(neighbors)

break;

endendend

function

neighbors = regionquery

(i, eps)

neighbors = find

(dmatrix(i,:)

<=eps);%返回dmatrix矩陣中第i行,小於eps的索引。

endnoise=~result;

end

基於密度的聚類演算法DBSCAN

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