遺傳演算法ga/gp中，適應度函式對進化方向有重要影響，也是影響執行效率的關鍵因素。在適應度函式設計上，應目標明確，讓系統按要求的方向進化。
經典的適應度函式有三類：
1. 基於絕對誤差的適應度函式
2. 基於相對誤差的適應度函式
3. 用條件控制的適應度函式：if 條件 then f=0.5 else f=0
在實際應用中，由於絕對誤差並不能完全評價近似值的精確度，基於相對誤差的適應度評價應用得更為普遍，但這種評價模型仍然有其自身的缺陷。在gp的符號回歸研究中，可使用統計學上常用的相關係數，可以將適應度函式改為復相關係數的平方值，即： fi
tnes
s=r2
=1−s
se/s
st其中 ： ss
e=∑i
=1m(
yi−y
̂ i)2
sst=∑i=
1m(y
i−y¯
)2 y
̂ i為y
i的估計
值，y¯
為y的平
均值，s
se為殘
差平方和
，sst
為總離差
平方和
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