hcp預處理pipeline:
資料夾結構以及每個檔案是什麼:
dtseries.nii是皮層資料,大小大概只有64k。資料裡面有乙個皮層位置模型,皮層資料與其點點對應。
兩個工具箱:
1. read cifti into matlab(使用這個toolbox才能將dtseries.nii檔案讀入):
2. hcp workbench(可用於顯示資料):
(直接安裝軟體即可,無需make檔案,**上還有tutorial)
* wb_view使用遇到問題:1. 本地使用時,cd到目錄下但是檔案wb_view無法執行,顯示不存在該檔案:要寫」./wb_view」。2. wb_view 可能在cluster上面執行過慢導致資料可載入但無法顯示。
* wb_command:
可以使用wb_command進行檔案格式轉換等功能,例如:把matlab處理得到的.nii檔案變成dtseries.nii檔案影射到皮層上去。
000002/mninonlinear/results/tfmri_emotion_ap/tfmri_emotion_ap.nii.gz(不是hcp資料,是task-base的)
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