R實現大文字檔案資料過濾的方法

2021-06-24 11:56:50 字數 1374 閱讀 8174

使用r語言過濾檔案資料是很普遍的操作,但有時我們會遇到比較大的檔案,這類檔案無法全部讀入記憶體處理,需要採用分批讀取、分批過濾、拼合結果的辦法來解決。下面用乙個例子來說明r實現大檔案資料過濾的方法。

有個1g的檔案sales.txt,儲存著大量訂單記錄,請過濾出amount字段值在2000和3000之間的記錄。該檔案的列分割符為「\t」,前幾行資料如下:

r語言解決方案

con

readlines(con,n=1)

result=read.table(con,nrows=100000,sep="\t")

result=2000 & result$v4<=3000,]

while(length(databatch

close(con)

部分計算結果 

**解讀:

1行:開啟檔案控制代碼

2行:丟掉第一行,也就是列名。

3-4行:讀入第一批的十萬條資料,過濾後存入result。

9行:關閉檔案控制代碼。

注意事項:

如果是小檔案,則只需一句**就能完成讀資料的操作,第一行還可以設定為資料框的列名,但大檔案不能這麼實現,需要按批次讀取資料,第二批的資料就無法將第一行設為列名了,預設列名會是v1、v2、v3…….。

為了實現大檔案按批次讀資料,必須使用while語句來實現演算法,列名的使用也不夠方便,這就使整個**稍顯複雜。 

替代方案:

同樣的演算法也可以用python、集算器、perl等語言來解決本案例。和r語言一樣,這幾種語言都可以實現檔案資料的過濾以及結構化資料的計算,下面簡單介紹集算器和python的解決方案。

集算器會自動分批處理資料,程式設計師無需用迴圈語句手工控制,因此**非常簡潔:

cursor是集算器中用於結構化資料計算的資料型別,和資料框的用法差不多,但對大檔案和複雜計算更擅長。另外,cursor可以用@t選項將檔案的第一行讀為列名。 

python的**結構和r差不多,也是手工控制迴圈,但python本身缺乏資料框或cursor等結構化資料型別,因此**更底層些:

python也可以用第三方包來實現上述演算法,比如pandas就有類似資料框的結構化資料物件,但pandas對大檔案的支援同樣有限,很難進一步簡化**。

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