磁碟碎片整理程式的主要作用是整理磁碟中一些分散的、不連續的扇區空間，以提高磁碟的讀寫速度。磁碟碎片指的是硬碟讀寫過程中產生的不連續檔案。磁碟碎片會加長硬碟的尋道時間，影響系統效能。
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詳細介紹：
磁碟碎片指的是硬碟讀寫過程中產生的不連續檔案。硬碟上非連續寫入的檔案會產生磁碟碎片，磁碟碎片會加長硬碟的尋道時間，影響系統效能。 比如虛擬記憶體使用了硬碟，硬碟上便會產生磁碟碎片， 所以磁碟碎片會加長硬碟的尋道時間，影響系統效能。
實際上，定期整理硬碟應該是毫無疑問的。如果說硬碟碎片整理真的會損害硬碟的話，那也將是在對硬碟進行近乎天文數字般次數的整理之後。硬碟使用的時間長了，檔案的存放位置就會變得支離破碎——檔案內容將會散布在硬碟的不同位置上。
這些碎片檔案的存在會降低硬碟的工作效率，還會增加資料丟失和資料損壞的可能性。碎片整理程式把這些碎片收集在一起，並把它們作為乙個連續的整體存放在硬碟上。windows自帶有這樣的程式：磁碟碎片整理程式（diskdefragmenter），但在工具軟體nortonutilities和nuts&bolts中有更好的此類程式。
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