測序分析軟體 phred的安裝

2022-08-12 01:57:15 字數 659 閱讀 8669

1.進入phred官網,給作者寫信,獲得所需的軟體,大約需要兩三天的時間即可收到回信。

3.以筆者本人的安裝為例unbuntu系統(phred自帶的installtion太麻煩了)

4.新建資料夾:

mkdir phred

mv phred-dist-071222.c-acd.tar.gz

6.解壓檔案

tar -zxvf phred-dist-071220.c-acd.tar.gz

7.編譯一下:

make

8:新增環境變數:

在home目錄下:vi .bashrc新增一下三行內容:

export path=/home/lmt/desktop/phred:$path

phred_parameter_file=/home/lmt/desktop/phred/phredpar.dat

export phred_parameter_file

9:啟用剛新增的環境變數:

source .bashrc

10:檢驗一下我們安裝的phred是否安裝好了及環境變數新增好了

在任何路徑下(非phred所在路徑)輸入一下命令:

phred -help

如果安裝正確,路徑新增正確,就會出現phred的用法提示。

11:安裝完成。

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