對於計算機來說，所謂的資料就是0和1的序列。這樣的乙個序列可以儲存在記憶體中，但記憶體中的資料會隨著關機而消失。為了將資料長久儲存，我們把資料儲存在光碟或者硬碟中。根據我們的需要，我們通常會將資料分開儲存到檔案這樣乙個個的小單位中(所謂的小，是相對於所有的資料而言)。但如果資料只能組織為檔案的話，而不能分類的話，檔案還是會雜亂無章。每次我們搜尋某乙個檔案，就要乙個檔案又乙個檔案地檢查，太過麻煩。檔案系統(file system)是就是檔案在邏輯上組織形式，它以一種更加清晰的方式來存放各個檔案。
檔案被組織到檔案系統(file system)中，通常會成為乙個樹狀(tree)結構。linux有乙個根目錄/, 也就是樹狀結構的最頂端。這個樹的分叉的最末端都代表乙個檔案，而這個樹的分叉處則是乙個目錄(directory, 相當於我們在windows介面中看到的資料夾)。在圖1中看到的是整個的乙個檔案樹。如果我們從該樹中擷取一部分，比如說從目錄vamei開始往下，實際上也構成乙個檔案系統。
要找到乙個檔案，除了要知道該檔案的檔名，還需要知道從樹根到該檔案的所有目錄名。從根目錄開始的所有途徑的目錄名和檔名構成乙個路徑(path)。比如說，我們在linux中尋找乙個檔案file.txt，不僅要知道檔名(file.txt)，還要知道完整路徑，也就是絕對路徑(/home/vamei/doc/file.txt)。從根目錄錄/, 也就是樹狀結構的最頂端出發，經過目錄home, vamei, doc，最終才看到檔案file.txt。整個檔案系統層層分級(hierarchy)，vamei是home的子目錄，而home是vamei的父目錄。
在linux中，我們用ls命令來顯示目錄下的所有檔案，比如$ls /home/vamei/doc
圖1 檔案樹
如該圖中所示的檔案系統，即綠色構成的樹。最頂端的根目錄(/)，沿紅色箭頭標出的路徑，我們最終找到檔案file.txt。
在linux系統中，目錄也是一種檔案。所以/home/vamei是指向目錄檔案vamei的絕對路徑。
這個檔案中至少包含有以下條目:
. 指向當前目錄
.. 指向父目錄
除此之外，目錄檔案中還包含有屬於該目錄的檔案的檔名，比如vamei中就還要有如下條目，指向屬於該目錄的檔案:
docmovie
photo
linux解釋乙個絕對路徑的方式如下：先找到根目錄檔案，從該目錄檔案中讀取home目錄檔案的位置，然後從home檔案中讀取vamei的位置……直到找到目錄doc中的file.txt的位置。
由於目錄檔案中都有.和..的條目，我們可以在路徑中加入.或者..來表示當前目錄或者父目錄，比如/home/vamei/doc/..與/home/vamei等同。
此外，linux會在程序中，維護乙個工作目錄(present working directory)的變數。在shell中，你可以隨時查詢到到工作目錄(在命令列輸入$pwd)。這是為了省去每次都輸入很長的絕對路徑的麻煩。比如說我們將工作目錄更改為/home/vamei ($cd /home/vamei)，那麼此時我們再去找file.txt就可以省去/home/vamei/ ($ls doc/file.txt)，這樣得到的路徑叫相對路徑(relative path)，上面的doc/file.txt就是這樣乙個相對路徑。
當檔案出現在乙個目錄檔案中時，我們就把檔案接入到檔案系統中，我們稱建立乙個到檔案的硬鏈結(hard link)。乙個檔案允許出現在多個目錄中，這樣，它就有多個硬鏈結。當硬鏈結的數目(link count)降為0時，檔案會被linux刪除。所以很多時候，unlink與remove在linux作業系統中是乙個意思。由於
軟鏈結(soft link)的廣泛使用(soft link不會影響link count，而且可以跨越檔案系統)，現在較少手動建立硬連線。
對於檔案，我們可以讀取(read)
，寫入(write)
和執行(execute)
。讀取是從已經存在的檔案中獲得資料。寫入是向新的檔案或者舊的檔案寫入資料。如果檔案儲存的是可執行的二進位製碼，那麼它可以被載入記憶體，作為乙個程式執行。在linux的檔案系統中，如果某個使用者想對某個檔案執行某一種操作，那麼該使用者必須擁有對該檔案進行這一操作的許可權。檔案許可權的資訊儲存在檔案資訊(metadata)中, 見下一節。
檔案自身包含的只有資料。檔名實際上儲存在目錄檔案。除了這些之外，還有作業系統維護的檔案附加資訊，比如檔案型別，檔案尺寸，檔案許可權，檔案修改時間，檔案讀取時間等。可以用ls命令查詢檔案資訊($ls -l file.txt)，得到如下結果：
-rw-r--r-- 1 vamei vamei 8445 sep 8 07:33 file1.txt
各個部分的含義如下：
如上討論硬鏈結時說到的，軟鏈結不會影響檔案的link count。如果還記得windows系統的快捷方式的話，linux的軟鏈結(soft link，也叫做symbolic link)就是linux的快捷方式。軟鏈結本質上是乙個檔案，它的檔案型別是symbolic link。在這個檔案中，包含有鏈結指向的檔案的絕對路徑。當你從這個檔案讀取資料時，linux會把你導向所指向的檔案，然後從那個檔案中讀取（就好像你雙擊快捷方式的效果一樣）。軟鏈結可以方便的在任何地方建立，並指向任何乙個絕對路徑。
軟鏈結本身也是乙個檔案，也可以執行檔案所可以進行的操作。當我們對軟鏈結操作時，要注意我們是對軟鏈結本身操作，還是對軟鏈結指向的目標操作。如果是後者，我們就說該操作跟隨鏈結指引(follow the link)
。當我們建立檔案的時候，比如使用touch，它會嘗試將新建檔案建立為許可權666，也就是rw-rw-rw-。但作業系統要參照許可權mask來看是否真正將檔案建立為666。許可權mask表示作業系統不允許設定的許可權位，比如說037(----wxrwx)的許可權mask意味著不允許設定設定group的wx位和other的rwx位。如果是這個許可權mask的話，最終的檔案許可權是rw-r----- (group的w位和other的rw位被mask)。
我們可以通過
$umask 022
的方式改變許可權mask。
計算機本質上是對資料進行處理的工具，而檔案是資料儲存的邏輯載體，所以了解linux檔案系統很重要。對於檔案系統的了解要結合linux的其他方面(比如使用者管理)進行有機的學習。
檔案許可權，擁有者，擁有組，超級使用者root
硬鏈結，軟鏈結，follow the link
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