對基因晶元資料的標準化處理,主要目的
是消除由於實驗技術所導致的表達量(intensity)的變化,並且使各個樣本(sample)和平行實驗的資料處於相同的水平,從而使我們可以得到具有生物學意義的基因表達量的變化。
中位數標準化(median normalization)
由於五種組織(seeding、tiller、root、panicle1、panicle2)是分別在五張晶元上作雜交試驗的, 所以第一步的標準化是將五張試驗晶元的資料調整到同一水平, 常用的方法是平均數、中位數標準化(mean or median normalization)
。即:將五組實驗的資料的log ratio
中位數或平均數調整為 0。
對於雙通道資料來說,這種標準化
資料的標準化和標準化方法
資料的標準化 normalization 是將資料按比例縮放,使之落入乙個小的特定區間。在某些比較和評價的指標處理中經常會用到,去除資料的單位限制,將其轉化為無量綱的純數值,便於不同單位或量綱的指標能夠進行比較和加權。其中最典型的就是資料的歸一化處理,即將資料統一對映到 0,1 區間上,常見的資料歸...
資料的標準化和標準化方法
資料的標準化 normalization 是將資料按比例縮放,使之落入乙個小的特定區間。在某些比較和評價的指標處理中經常會用到,去除資料的單位限制,將其轉化為無量綱的純數值,便於不同單位或量綱的指標能夠進行比較和加權。其中最典型的就是資料的歸一化處理,即將資料統一對映到 0,1 區間上,常見的資料歸...
資料標準化
從廣義上來講,資料標準化的過程可以看作是業務系統內部或業務系統之間,乃至整個資料治理系統中的乙個 語言 統一的過程。只有語言統一,才能讓同一業務系統或者不同業務系統之間有了對話 呼叫 通訊的可能,從而保證使用的都是特定的某乙個方言。同樣,資料標準化的過程反映程式及系統設計或架構級別時,就可以看作連線...