2.解壓並配置環境
mkdir ~/sratoolkit #先建立乙個放工具的資料夾
cd ~/sratoolkit
wget
解壓縮
tar xzvf sratoolkit.2.10.9-ubuntu64.tar.gz
配置環境
echo 'export path=$path:$home/sratoolkit/sratoolkit.2.10.9-ubuntu64/bin ' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
vdb-config --interactive #會出現乙個框架,按字母x鍵退出,然後就可以使用啦
fastq-dump --split-e ./srr1553610/srr1553610.sra #將.sra檔案轉換成.fastq檔案
經測,速度很快
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